T细胞受体信号的定量磷蛋白组学分析揭示了蛋白质-蛋白质相互作用的全系统调节。

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Mayya V, Lundgren DH, Hwang SI, Rezaul K, Wu L, Eng JK, Rodionov V, Han DK

T细胞受体信号的定量磷蛋白组学分析揭示了蛋白质-蛋白质相互作用的全系统调节。

科学信号。2009 Aug 18;2(84):ra46。doi: 10.1126 / scisignal.2000007。

PubMed ID

19690332 (查看PubMed

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摘要

T细胞受体(TCR)信号转导过程中的蛋白质磷酸化事件控制着TCR附近蛋白质之间复合物的形成、激酶级联的激活和转录因子的激活;然而，磷酸化在协调与T细胞活化相关的各种现象中的影响方式和程度尚不清楚。因此，我们使用人Jurkat T细胞白血病细胞系作为模型系统，对TCR信号进行了大规模定量磷蛋白组学分析。我们鉴定了10,665个独特的磷酸化位点，其中696个位点显示了tcr响应性变化。此外，我们分析了磷酸化数据集的广泛趋势，以揭示与T细胞激活相关的潜在机制。我们发现，在TCR的刺激下，磷酸化事件广泛靶向蛋白模块，涉及与T细胞激活相关的所有显著现象:表面蛋白的模式化、TCR的内吞作用、F-actin杯的形成、整合素的内外激活、微管的极化、细胞因子的产生和信使RNA的选择性剪接。此外，对属于相关功能模块的蛋白质上的tcr响应磷酸化位点进行个案分析，并结合网络分析，使我们推断出丝氨酸-苏氨酸(S-T)磷酸化在系统范围内调节蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)。我们还通过展示微管组装过程中六种不同丝氨酸残基上的微管蛋白磷酸化可以去除PPIs，为这一推论提供了实验支持。我们提出，通过S-T磷酸化状态的刺激依赖性变化来调节PPIs是一种广泛存在的现象，适用于许多其他信号系统。

引用本文的药库数据

多肽

的名字	UniProt ID
电压依赖性t型钙通道亚基α - 1i	Q9P0X4	细节
酪氨酸蛋白激酶ABL1	P00519	细节
NADH脱氢酶[泛素]黄蛋白3，线粒体	P56181	细节
7-dehydrocholesterol还原酶	Q9UBM7	细节
RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	P04049	细节
转酮醇酶	P29401	细节
凝血因子V	P12259	细节
l -乳酸脱氢酶B链	P07195	细节
丙酮酸激酶PKM	P14618	细节
钾电压门控通道亚族H成员2	Q12809	细节
溶质载体家族22个成员5	O76082	细节
溶质载体家族12个成员6	Q9UHW9	细节
DNA连接酶3	P49916	细节
双功能谷氨酸/脯氨酸-tRNA连接酶	P07814	细节
DNA连接酶1	P18858	细节
中性氨基酸转运蛋白B(0)	Q15758	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基β -1	Q9Y478	细节
t细胞表面糖蛋白CD3 epsilon链	P07766	细节
溶质载体家族12个成员7	Q9Y666	细节
GMP合成酶【谷氨酰胺水解】	P49915	细节
Thymidylate合酶	P04818	细节
过氧化物酶体多功能酶2型	P51659	细节
钙调蛋白	P0DP23	细节
l -乳酸脱氢酶A链	P00338	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶A-Raf	P10398	细节
Abelson酪氨酸蛋白激酶2	P42684	细节
中性氨基酸转运蛋白A	P43007	细节
血清白蛋白	P02768	细节
染色体域解旋酶dna结合蛋白1	O14646	细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶	P04406	细节
DNA聚合酶α催化亚基	P09884	细节
整合素alpha 4	P13612	细节
溶质载体家族12个成员4	Q9UP95	细节
磷酸胆碱酰酰基转移酶	P49585	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
camp特异性3'，5'-环磷酸二酯酶7B	Q9NP56	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B-raf	P15056	细节
nadh -泛素氧化还原酶链2	P03891	细节
干扰素受体1	P17181	细节
5'- amp激活的蛋白激酶催化亚基α -1	Q13131	细节
DNA聚合酶亚基B	Q14181	细节
钠/钾转运atp酶亚基α -1	P05023	细节
胆绿素还原酶A	P53004	细节
DNA拓扑异构酶2- α	P11388	细节
钠/氢交换器	P19634	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基β -2	O43741	细节
鞘甘氨酸-1-磷酸裂解酶1	O95470	细节
苹果酸脱氢酶，线粒体	P40926	细节
多药耐药相关蛋白1	P33527	细节
糖皮质激素受体	P04150	细节
原癌基因酪氨酸蛋白激酶	P12931	细节
酪氨酸蛋白激酶Lck	P06239	细节
CTP合成酶1	P17812	细节
组蛋白去乙酰化酶	Q9UKV0	细节
信号转换器和转录激活器5B	P51692	细节
DNA(胞嘧啶-5)甲基转移酶1	P26358	细节
生长因子受体结合蛋白2	P62993	细节
丝裂原激活蛋白激酶1	P28482	细节
磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基α	P27986	细节
环amp响应元件结合蛋白1	P16220	细节
胰岛素受体底物1	P35568	细节
连环蛋白beta 1	P35222	细节
Thiopurine S-methyltransferase	P51580	细节
突触囊泡糖蛋白2A	Q7L0J3	细节
磷脂转运atp酶IA	Q9Y2Q0	细节
E3泛素蛋白连接酶Mdm2	Q00987	细节
Calnexin	P27824	细节
rho相关蛋白激酶1	Q13464	细节
丝裂原激活蛋白激酶	Q16539	细节
转录因子AP-1	P05412	细节
GTP环水解酶1	P30793	细节
丝裂原激活蛋白激酶3	P27361	细节
糖原合成酶激酶-3 β	P49841	细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体11型	Q06124	细节
周期蛋白依赖性激酶2	P24941	细节
周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
核因子NF-kappa-B p105亚基	P19838	细节
CD44抗原	P16070	细节
热休克蛋白hsp90 - α	P07900	细节
原癌基因c-Fos	P01100	细节
蛋白激酶C型	P17252	细节
camp特异性3'，5'-环磷酸二酯酶4A	P27815	细节
肌醇单磷酸酶1	P29218	细节
核因子kappa-B激酶亚基β的抑制剂	O14920	细节
微管相关蛋白1A	P78559	细节
rac - β丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	P31751	细节
14-3-3蛋白zeta/delta	P63104	细节
磷脂酰乙醇胺结合蛋白	P30086	细节
多药耐药相关蛋白4	O15439	细节
3-磷酸肌苷依赖性蛋白激酶	O15530	细节
Glucose-6-phosphate异构酶	P06744	细节
蛋白质谷氨酰胺-谷氨酰基转移酶E	Q08188	细节
酪氨酸蛋白激酶ZAP-70	P43403	细节
酪氨酸蛋白激酶SYK	P43405	细节
酪氨酸蛋白激酶ITK/TSK	Q08881	细节
蛋白激酶C型	Q04759	细节
微管蛋白α - 1c链	Q9BQE3	细节
DNA修复蛋白XRCC4	Q13426	细节
二磷酸果糖醛缩酶A	P04075	细节
m相诱导磷酸酶2	P30305	细节
聚[adp -核糖]聚合酶1	P09874	细节
周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
硫氧还蛋白还原酶1，细胞质	Q16881	细节
细胞因子受体共同亚单位伽马	P31785	细节
层粘连蛋白亚基α -5	O15230	细节
Retinoblastoma-associated蛋白质	P06400	细节
甲基丙二酸尿和同型胱氨酸尿C型蛋白	Q9Y4U1	细节
甲硫氨酸腺苷转移酶2亚基β	Q9NZL9	细节
周期蛋白依赖性激酶6	Q00534	细节
腺苷脱氨酶	P00813	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
CAD蛋白质	P27708	细节
Phosphoribosylformylglycinamidine合酶	O15067	细节
N-acetyl-D-glucosamine激酶	Q9UJ70	细节
肽酰脯氨酰顺反异构酶G	Q13427	细节
组蛋白去乙酰化酶1	Q13547	细节
组蛋白去乙酰化酶2	Q92769	细节
组蛋白去乙酰化酶3	O15379	细节
磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基β	O00459	细节
dna依赖性蛋白激酶催化亚基	P78527	细节
蛋白激酶C δ型	Q05655	细节
DNA拓扑异构酶2- β	Q02880	细节
核糖核苷二磷酸还原酶亚基M2	P31350	细节
E3泛素蛋白连接酶UBR4	Q5T4S7	细节
依赖nadd的蛋白去乙酰化酶sirtuin-1	Q96EB6	细节
端粒酶结合蛋白EST1A	Q86US8	细节
前列腺素E合成酶3	Q15185	细节
维斯科特-奥尔德里奇综合征蛋白	P42768	细节
Gephyrin	Q9NQX3	细节
炭疽毒素受体2	P58335	细节
Pleckstrin同源结构域A家族成员1	Q9HB21	细节
酪蛋白激酶I亚型γ -2	P78368	细节
wee1样蛋白激酶	P30291	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Chk1	O14757	细节
微管蛋白-6链	Q9BUF5	细节
bcl -2样蛋白2	Q92843	细节
bcl2相关细胞死亡激动剂	Q92934	细节
远上游元素结合蛋白1	Q96AE4	细节
camp依赖性蛋白激酶ii - α调节亚基	P13861	细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基	P10644	细节
t细胞表面糖蛋白CD3 δ链	P04234	细节
t细胞表面糖蛋白CD3伽马链	P09693	细节
t细胞表面糖蛋白CD3 zeta链	P20963	细节
微管相关蛋白4	P27816	细节
肌浆/内质网钙atp酶2	P16615	细节
肿瘤坏死因子受体超家族成员8	P28908	细节
酪氨酸蛋白激酶JAK3	P52333	细节
跨膜前后转化蛋白1同源物	Q6NXT6	细节
酪蛋白激酶I亚型	P49674	细节
热休克因子蛋白1	Q00613	细节
组蛋白去乙酰化酶4	P56524	细节
组蛋白去乙酰化酶7	Q8WUI4	细节
双3'，5'-环- amp和-GMP磷酸二酯酶11A	Q9HCR9	细节
血清对氧磷酶/内酯酶3	Q15166	细节
受体型酪氨酸蛋白磷酸酶	P23469	细节
整合素beta 1	P05556	细节
Nischarin	Q9Y2I1	细节
不依赖阳离子的甘露糖-6-磷酸受体	P11717	细节
铜转运atp酶1	Q04656	细节
核受体共激活剂2	Q15596	细节
camp依赖的蛋白激酶催化亚基α	P17612	细节
Uracil-DNA糖基化酶	P13051	细节
热休克同源蛋白71 kDa	P11142	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
内皮素转换酶	P42892	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	Q8TF76	细节
内着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
60S核糖体蛋白L37	P61927	细节
Triosephosphate异构酶	P60174	细节
蛋白激酶C iota型	P41743	细节
蛋白酶体亚基阿尔法-2型	P25787	细节
蛋白酶体亚基阿尔法-3型	P25788	细节
蛋白酶体亚基α -5型	P28066	细节
双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶1A	Q13627	细节
ste20样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	Q9H2G2	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶IV型	Q16566	细节
双特异性蛋白激酶CLK3	P49761	细节
核受体辅激活剂	Q9HCD5	细节
羟甲基戊二酰辅酶a合酶，细胞质	Q01581	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶II型亚基delta	Q13557	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶26	Q9P289	细节
Profilin-1	P07737	细节
MKL/心肌样蛋白1	Q969V6	细节
Cofilin-1	P23528	细节
rho相关蛋白激酶2	O75116	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基1B	O15143	细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合亚基3	O15145	细节
SRSF蛋白激酶2	P78362	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶17B	O94768	细节
Afadin	P55196	细节
白细胞介素-1受体相关激酶	Q9NWZ3	细节
CREB-binding蛋白质	Q92793	细节
RNA聚合酶II转录亚基1的介质	Q15648	细节
蛋白质精氨酸n -甲基转移酶	O60678	细节
Epsin-1	Q9Y6I3	细节
Phosphoglucomutase-1	P36871	细节
波形蛋白	P08670	细节
camp依赖性蛋白激酶催化亚基β	P22694	细节
ras相关蛋白rabbit - 8b	Q92930	细节
camp依赖性蛋白激酶ii型- β调节亚基	P31323	细节
聚(A)聚合酶	P51003	细节
3-酮酰基辅酶a硫醇酶，过氧化物酶体	P09110	细节
nad依赖性蛋白去乙酰化酶sirtuin-3，线粒体	Q9NTG7	细节
t复合体蛋白1亚基γ	P49368	细节
羧肽酶D	O75976	细节
过渡内质网atp酶	P55072	细节
泛素样修饰物激活酶1	P22314	细节
组蛋白乙酰转移酶KAT5	Q92993	细节
染色质亚家族A成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调控因子5	O60264	细节
尿苷胞苷激酶样1	Q9NWZ5	细节
Spectrin β链，非红细胞1	Q01082	细节
激酶样蛋白KIF2C	Q99661	细节
乙酰胆碱受体亚单位	P02708	细节
碳酸氢钠共转运蛋白	Q9Y6M7	细节
断点簇区域蛋白质	P11274	细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶2	P36507	细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶2	Q9Y2U5	细节
rala结合蛋白1	Q15311	细节
5'(3')-脱氧核糖核苷酸酶，胞质型	Q8TCD5	细节
转铁蛋白受体蛋白	P02786	细节
核糖体蛋白S6激酶α -3	P51812	细节
膜相关孕酮受体成分1	O00264	细节
肌醇1,4,5-三磷酸受体3型	Q14573	细节
环amp依赖性转录因子ATF-1	P18846	细节
环amp依赖性转录因子ATF-2	P15336	细节
补体成分1q子成分结合蛋白，线粒体	Q07021	细节
丝裂原活化蛋白激酶	Q9NYL2	细节
Alpha-enolase	P06733	细节
PML蛋白	P29590	细节
核仁和盘体磷酸蛋白1	Q14978	细节
tgf - β激活激酶1和map3k7结合蛋白1	Q15750	细节
蛋白质O-GlcNAcase	O60502	细节
拉到	P46939	细节
Nucleobindin-2	P80303	细节
Calmodulin-2	P0DP24	细节
Calmodulin-3	P0DP25	细节
60 kDa热休克蛋白，线粒体	P10809	细节
40S核糖体蛋白S2	P15880	细节
异构核核糖核蛋白A2/B1	P22626	细节
异质核核糖核蛋白H	P31943	细节
异质核核糖核蛋白H3	P31942	细节
拼接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺	P23246	细节
真核翻译起始因子6	P56537	细节
14-3-3蛋白β / α	P31946	细节
肝癌衍生生长因子	P51858	细节
磷酸甘油酸变化酶	P18669	细节
兰氏特异性gtpase激活蛋白	P43487	细节
蛋白质二硫异构酶A3	P30101	细节
磷脂酰肌醇4-激酶型2- β	Q8TCG2	细节
杭丁顿蛋白	P42858	细节
淋巴样增强因子结合因子1	Q9UJU2	细节
真核翻译起始因子3亚基F	O00303	细节
异质核核糖核蛋白K	P61978	细节
热休克70 kDa蛋白4	P34932	细节
拼接因子3A亚基3	Q12874	细节
染色质E亚家族成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调控因子1	Q969G3	细节
肿瘤蛋白D54	O43399	细节
泛素羧基端水解酶	P54578	细节
14-3-3蛋白eta	Q04917	细节
14-3-3蛋白质	P27348	细节
染色体盒蛋白同源物5	P45973	细节
角蛋白，II型细胞骨架	P04264	细节
Desmoplakin	P15924	细节
Hornerin	Q86YZ3	细节
KAT8调节NSL复合体亚基3	Q9P2N6	细节
远上游元素结合蛋白2	Q92945	细节
富含半胱氨酸和甘氨酸的蛋白质	P21291	细节
Filamin-A	P21333	细节
异质核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
异染色质蛋白1-结合蛋白3	Q5SSJ5	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60S核糖体蛋白L14	P50914	细节
40S核糖体蛋白S17	P08708	细节
40S核糖体蛋白S8	P62241	细节
拼接因子1	Q15637	细节
Transgelin-2	P37802	细节
Zyxin	Q15942	细节
生存运动神经元蛋白	B4DP61	细节
Myosin-9	P35579	细节
剪接因子3B亚基1	O75533	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶3	Q13188	细节
酪氨酸蛋白激酶Tec	P42680	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶38	Q15208	细节
STE20/ sps1相关富脯氨酸-丙氨酸蛋白激酶	Q9UEW8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶TAO1	Q7L7X3	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶蓬乱样1	Q9UKI8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶蓬乱样2	Q86UE8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶ULK1	O75385	细节
ap2相关蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
bmp -2诱导蛋白激酶	Q9NSY1	细节
香橼铑相互作用激酶	O14578	细节
干扰素诱导的双链rna激活蛋白激酶	P19525	细节
Cyclin-G-associated激酶	O14976	细节
糖原合成酶激酶-3	P49840	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SIK3	Q9Y2K2	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LATS1	O95835	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶10	Q02779	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶11	Q16584	细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶12	Q12852	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶3	Q99759	细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶4	Q9Y6R4	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶1	Q92918	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶2	Q12851	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶4	O95819	细节
MAP激酶激活蛋白激酶5	Q8IW41	细节
MAP/微管亲和调节激酶3	P27448	细节
clip - associated protein 1	Q7Z460	细节
巨核细胞相关酪氨酸蛋白激酶	P42679	细节
母体胚胎亮氨酸拉链激酶	Q14680	细节
畸形样激酶1	Q8N4C8	细节
MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2	Q9HBH9	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Nek4	P51957	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Nek9	Q8TD19	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1	O95747	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 1	Q13153	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 2	Q13177	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 4	O96013	细节
周期蛋白依赖性激酶17	Q00537	细节
磷脂酰肌醇4-激酶	Q9UBF8	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶N2	Q16513	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PRP4同源物	Q13523	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RIO1	Q9BRS2	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RIO2	Q9BVS4	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SIK2	Q9H0K1	细节
snf相关丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	Q9NRH2	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶10	O94804	细节
组蛋白赖氨酸n -甲基转移酶EZH2	Q15910	细节
磷酸甘油酸激酶2	P07205	细节
丝裂原激活蛋白激酶6	Q16659	细节
依赖nadd的蛋白去乙酰化酶sirtuin-2	Q8IXJ6	细节
Sulfotransferase 4 a1	Q9BR01	细节
电压门控钾通道亚基-2	Q13303	细节
细胞色素b还原酶1	Q53TN4	细节
atp柠檬酸合酶	P53396	细节
溶质载体家族23个成员	Q9UGH3	细节
钠偶联中性氨基酸转运蛋白2	Q96QD8	细节
锌转运蛋白ZIP3	Q9BRY0	细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体型6	P29350	细节
钼嘌呤合酶催化亚基	O96007	细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1	Q13541	细节
1-磷脂酰肌醇4,5-二磷酸磷酸二酯酶-2	P16885	细节
赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1A	O60341	细节
信号换能器和转录激活器1- α / β	P42224	细节
增殖标志蛋白Ki-67	P46013	细节
G1 / S-specific cyclin-D3	P30281	细节
组蛋白乙酰转移酶p300	Q09472	细节
elav样蛋白1	Q15717	细节
camp依赖性蛋白激酶i型β调控亚基	P31321	细节
bcl -2样蛋白11	O43521	细节