激酶选择性富集使激酶组的定量磷蛋白质组学跨越细胞周期。

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Daub H, Olsen JV, Bairlein M, Gnad F, Oppermann FS, Korner R, Greff Z, Keri G, Stemmann O, Mann M

激酶选择性富集使激酶组的定量磷蛋白质组学跨越细胞周期。

Mol Cell. 2008 8月8日;31(3):438-48。doi: 10.1016 / j.molcel.2008.07.007。

PubMed ID

18691976 (在PubMed

］

摘要

蛋白激酶是细胞信号转导的关键调节因子，通过位点特异性磷酸化事件调节彼此的功能和活性。这些关键的调控修饰还没有得到全面的研究，因为激酶的低细胞丰度导致它们在先前的磷蛋白组研究中的代表性不足。本研究将激酶选择性亲和纯化与定量质谱相结合，分析蛋白质激酶的细胞周期调控。这种蛋白质组学方法使我们能够量化从S期和M期停滞的人类癌细胞中提取的219个蛋白激酶。我们在蛋白激酶上发现了超过1000个磷酸化位点。有趣的是，半数的激酶磷酸肽在有丝分裂中被上调。我们的数据显示有丝分裂功能的激酶上有许多未知的M相诱导磷酸化位点。我们还发现潜在的磷酸化网络涉及许多蛋白激酶，以前没有涉及有丝分裂进程。这些结果为激酶的功能研究及其通过位点特异性磷酸化的调节提供了广泛的知识基础。

引用本文的药库数据

多肽

的名字	UniProt ID
酪氨酸受体激酶ABL1	P00519	细节
NADH脱氢酶[泛素]黄蛋白3，线粒体	P56181	细节
胱氨酸/谷氨酸转运体	Q9UPY5	细节
7-dehydrocholesterol还原酶	Q9UBM7	细节
RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	P04049	细节
苯丙氨酸-tRNA连接酶α亚基	Q9Y285	细节
吡哆醛激酶	O00764	细节
丙酮酸激酶11	P14618	细节
Monocarboxylate运输机7	O15403	细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶	P07814	细节
大的中性氨基酸转运小亚基1	Q01650	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基β -1	Q9Y478	细节
钠和氯依赖肌酸转运蛋白1	P48029	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶A-Raf	P10398	细节
Abelson酪氨酸蛋白激酶2	P42684	细节
组胺H1受体	P35367	细节
Monocarboxylate运输车4	O15427	细节
酪氨酸蛋白激酶受体erbB-2	P04626	细节
Chromodomain-helicase-DNA-binding蛋白1	O14646	细节
蛋氨酸tRNA连接酶,胞质	P56192	细节
丙酮酸脱氢酶E1组分α亚基，体细胞形态，线粒体	P08559	细节
NADH脱氢酶[泛素]1 β亚复合体9亚基	Q9Y6M9	细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体1型	P18031	细节
ADP / ATP移位酶3	P12236	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
cAMP和cAMP抑制的cGMP 3'，5'-环磷酸二酯酶10A	Q9Y233	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶b - raf	P15056	细节
Monocarboxylate转运体1	P53985	细节
5'- amp激活的蛋白激酶催化亚基α -1	Q13131	细节
维甲酸诱导蛋白3	Q8NFJ5	细节
DNA拓扑异构酶2α	P11388	细节
表皮生长因子受体	P00533	细节
激活CDC42激酶1	Q07912	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基β -2	O43741	细节
Sphingosine-1-phosphate裂合酶1	O95470	细节
多药耐药相关蛋白1	P33527	细节
糖皮质激素受体	P04150	细节
原癌基因酪氨酸蛋白激酶	P12931	细节
酪氨酸受体激酶菲英岛	P06241	细节
酪氨酸受体激酶是的	P07947	细节
Ephrin a型受体2	P29317	细节
酪氨酸受体激酶Lck	P06239	细节
胰岛素样生长因子1受体	P08069	细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶1	Q02750	细节
酪氨酸蛋白激酶2β	Q14289	细节
CTP合酶1	P17812	细节
Cyclin-dependent-like激酶5	Q00535	细节
信号转换器和转录激活器5B	P51692	细节
肝细胞生长因子受体	P08581	细节
丝裂原激活蛋白激酶1	P28482	细节
凋亡诱导因子1，线粒体	O95831	细节
极光激酶的	O14965	细节
Calnexin	P27824	细节
rho相关蛋白激酶1	Q13464	细节
丝裂原激活蛋白激酶	Q16539	细节
Proton-coupled叶酸运输车	Q96NT5	细节
溶质载体家族2，葡萄糖转运蛋白家族1	P11166	细节
丝裂原激活蛋白激酶3	P27361	细节
糖原合成酶激酶-3 β	P49841	细节
管状多特异性有机阴离子转运蛋白	Q92887	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶2	P24941	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
Long-chain-fatty-acid——辅酶a连接酶3	O95573	细节
磷脂酰丝氨酸合酶1	P48651	细节
CD44抗原	P16070	细节
热休克蛋白hsp90 - α	P07900	细节
蛋白激酶C型	P17252	细节
核因子kappa-B激酶亚基β的抑制剂	O14920	细节
14-3-3蛋白ζ/δ	P63104	细节
酪蛋白激酶II亚基α	P68400	细节
蛋白激酶C型	Q04759	细节
微管蛋白alpha-1C链	Q9BQE3	细节
微管蛋白alpha-4A链	P68366	细节
Uridine-cytidine激酶2	Q9BZX2	细节
双特异性蛋白激酶CLK1	P49759	细节
鉴定及受体2型	P37173	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
角蛋白，II型细胞骨架	P05787	细节
胆碱/ ethanolaminephosphotransferase 1	Q9Y6K0	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶9	P50750	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
CAD蛋白质	P27708	细节
磷脂酰丝氨酸合酶2	Q9BVG9	细节
鞘磷脂磷酸二酯酶4	Q9NXE4	细节
组蛋白脱乙酰酶1	Q13547	细节
组蛋白脱乙酰酶2	Q92769	细节
dna依赖性蛋白激酶催化亚基	P78527	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶mTOR	P42345	细节
NF-kappa-B必不可少的调制器	Q9Y6K9	细节
蛋白激酶C δ型	Q05655	细节
核糖核苷二磷酸还原酶亚基M2	P31350	细节
Ephrin b型受体	P54760	细节
角蛋白，II型细胞骨架	P08729	细节
E3泛素蛋白连接酶UBR4	Q5T4S7	细节
电压依赖性阴离子选择通道蛋白1	P21796	细节
电压依赖性阴离子选择通道蛋白2	P45880	细节
前列腺素E合成酶3	Q15185	细节
脱氧胞苷激酶	P27707	细节
局部粘附激酶1	Q05397	细节
整合素β4	P16144	细节
酪蛋白激酶I亚型γ -2	P78368	细节
Wee1-like蛋白激酶	P30291	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1	O14757	细节
极光激酶B	Q96GD4	细节
杆状病毒含IAP重复蛋白5	O15392	细节
camp依赖性蛋白激酶ii - α调节亚基	P13861	细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基	P10644	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶1	Q13233	细节
蛋白激酶C型	Q02156	细节
热休克蛋白-1	P04792	细节
信号换能器和转录激活器3	P40763	细节
Ribosome-binding蛋白1	Q9P2E9	细节
肌浆/内质网钙atp酶2	P16615	细节
酪蛋白激酶I亚型	P49674	细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体	P11717	细节
溶质载体有机阴离子运输家族成员4A1	Q96BD0	细节
矩阵metalloproteinase-15	P51511	细节
高亲和力camp特异性和ibmx不敏感的3'，5'-环磷酸二酯酶8A	O60658	细节
磷脂酰肌醇3-激酶催化亚基3型	Q8NEB9	细节
Cyclin-A2	P20248	细节
核受体共激活剂2	Q15596	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PLK1	P53350	细节
camp依赖的蛋白激酶催化亚基α	P17612	细节
丝裂原激活蛋白激酶	P45983	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek2	P51955	细节
内心的着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
60S核糖体蛋白L23	P62829	细节
60S核糖体蛋白L19	P84098	细节
60S核糖体蛋白L37	P61927	细节
60S核糖体蛋白L11	P62913	细节
蛋白激酶C iota型	P41743	细节
蛋白酶体亚基α -5型	P28066	细节
酪蛋白激酶I亚型-3	Q9Y6M4	细节
酪蛋白激酶II亚基α '	P19784	细节
双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶1A	Q13627	细节
STE20-like丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9H2G2	细节
双特异性蛋白激酶CLK3	P49761	细节
香叶酰香叶酰转移酶2型亚基β	P53611	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶16	Q00536	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Sgk1	O00141	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶II型亚基delta	Q13557	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶26	Q9P289	细节
非受体酪氨酸蛋白激酶TYK2	P29597	细节
rho相关蛋白激酶2	O75116	细节
核糖体蛋白S6激酶α -1	Q15418	细节
酪氨酸受体激酶林恩	P07948	细节
SRSF蛋白激酶2	P78362	细节
白细胞介素-1受体相关激酶	Q9NWZ3	细节
RNA聚合酶II转录亚基1的介质	Q15648	细节
钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶II型亚基γ	Q13555	细节
母亲对抗十五头瘫痪同系物2	Q15796	细节
波形蛋白	P08670	细节
Ephrin b型受体2	P29323	细节
[3-甲基-2-氧丁酸脱氢酶[脂酰胺]]激酶，线粒体	O14874	细节
过渡内质网atp酶	P55072	细节
fad连接巯基氧化酶ALR	P55789	细节
染色质亚家族A成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调控因子5	O60264	细节
Spectrin β链，非红细胞1	Q01082	细节
核糖体蛋白S6激酶α -4	O75676	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO2	Q9UL54	细节
酪氨酸蛋白激酶6	Q13882	细节
酪氨酸受体激酶FRK	P42685	细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶2	P36507	细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶2	Q9Y2U5	细节
LIM结构域激酶1	P53667	细节
丝氨酸即激酶ATM	Q13315	细节
核糖体蛋白S6激酶α -3	P51812	细节
蛋白激酶C zeta型	Q05513	细节
膜相关孕酮受体成分1	O00264	细节
5'- amp激活的蛋白激酶催化亚基α -2	P54646	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基-1	P54619	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基-2	Q9UGJ0	细节
组蛋白H1.4	P10412	细节
溶质载体家族2，葡萄糖转运蛋白家族6	Q9UGQ3	细节
酪蛋白激酶II亚基β	P67870	细节
丝裂原活化蛋白激酶	Q9NYL2	细节
异构核核糖核蛋白A2/B1	P22626	细节
异质核核糖核蛋白H	P31943	细节
异质核核糖核蛋白H3	P31942	细节
Hepatoma-derived生长因子	P51858	细节
杭丁顿蛋白	P42858	细节
Prohibitin-2	Q99623	细节
Beclin-1	Q14457	细节
异质核核糖核蛋白F	P52597	细节
异质核核糖核蛋白K	P61978	细节
肿瘤蛋白质D54	O43399	细节
14-3-3蛋白θ	P27348	细节
染色体盒蛋白同源物5	P45973	细节
角蛋白，II型细胞骨架	P04264	细节
角蛋白，I型细胞骨架10	P13645	细节
角蛋白，II型细胞骨架2表皮	P35908	细节
Desmoplakin	P15924	细节
角蛋白，I型细胞骨架	P02533	细节
远上游元素结合蛋白2	Q92945	细节
Filamin-A	P21333	细节
异质核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60S核糖体蛋白L14	P50914	细节
60S核糖体蛋白L18	Q07020	细节
60S核糖体蛋白L4	P36578	细节
40S核糖体蛋白S13	P62277	细节
40S核糖体蛋白S6	P62753	细节
40S核糖体蛋白S9	P46781	细节
生存运动神经元蛋白	B4DP61	细节
骨形态发生蛋白受体2型	Q13873	细节
剪接因子3B亚基1	O75533	细节
超长链脂肪酸延伸蛋白5	Q9NYP7	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶24	Q9Y6E0	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶3	Q13188	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶33	Q9BYT3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO1	Q7L7X3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO3	Q9H2K8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TBK1	Q9UHD2	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶蓬乱样2	Q86UE8	细节
TRAF2和nck相互作用蛋白激酶	Q9UKE5	细节
非受体酪氨酸蛋白激酶TNK1	Q13470	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK1	O75385	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK3	Q6PHR2	细节
ap2相关蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
酪氨酸蛋白激酶受体UFO	P30530	细节
BMP-2-inducible蛋白激酶	Q9NSY1	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶激酶1	Q8N5S9	细节
钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶2	Q96RR4	细节
双特异性蛋白激酶CLK2	P49760	细节
双特异性蛋白激酶CLK4	Q9HAZ1	细节
酪蛋白激酶I亚型	P48729	细节
真核翻译起始因子2- α激酶1	Q9BQI3	细节
eIF-2-alpha激酶GCN2	Q9P2K8	细节
酪氨酸受体激酶拿来	P16591	细节
Cyclin-G-associated激酶	O14976	细节
糖原合成酶激酶-3	P49840	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶难闻	Q9UPZ9	细节
白细胞介素-1受体相关激酶1	P51617	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶LATS1	O95835	细节
LIM结构域激酶2	P53671	细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶5	Q13163	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶11	Q16584	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶3	Q99759	细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶6	O95382	细节
丝裂原激活蛋白激酶激酶激酶激酶4	O95819	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK1	Q9P0L2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK2	Q7KZI7	细节
MAP/微管亲和调节激酶3	P27448	细节
Megakaryocyte-associated酪氨酸受体激酶	P42679	细节
母体胚胎亮氨酸拉链激酶	Q14680	细节
Misshapen-like激酶1	Q8N4C8	细节
MAP激酶相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2	Q9HBH9	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek1	Q96PY6	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek9	Q8TD19	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 4	O96013	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶17	Q00537	细节
磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶2型β	P78356	细节
磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶-2型	Q8TBX8	细节
膜相关的酪氨酸和苏氨酸特异性cdc2抑制激酶	Q99640	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PLK4	O00444	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO2	Q9BVS4	细节
受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶2	O43353	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶10	O94804	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2	Q15910	细节
Exportin-1	O14980	细节
atp柠檬酸合酶	P53396	细节
钠偶联中性氨基酸转运蛋白1	Q9H2H9	细节
锌转运体ZIP10	Q9ULF5	细节
锌转运蛋白5	Q8TAD4	细节
锌转运体zip2	Q9BRY0	细节
锌转运蛋白6	Q6NXT4	细节
v型质子atp酶亚基H	Q9UI12	细节
钼嘌呤合酶催化亚基	O96007	细节
受体酪氨酸蛋白激酶	Q504U8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ATR	Q13535	细节
赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1A	O60341	细节
信号换能器和转录激活器1- α / β	P42224	细节
增殖标志蛋白Ki-67	P46013	细节
camp依赖性蛋白激酶i型β调控亚基	P31321	细节