碎屑hPepT2建模和分析其绑定功能的对接研究和药效基因映射。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

Pedretti, De Luca L,马可尼C, Regazzoni L, Aldini G, Vistoli G

碎屑hPepT2建模和分析其绑定功能的对接研究和药效基因映射。

Bioorg医疗化学。2011年8月1;19 (15):4544 - 51。doi: 10.1016 / j.bmc.2011.06.027。Epub 2011年6月16日。

PubMed ID

21741846 (在PubMed

]

文摘

过去多年来,已取得相当大的进展的识别和表征药物转运蛋白,和几个研究已经进行预测建模对ADME分析的影响。因此,本研究集中在肽转运hPepT2,影响大脑区域药物动力学,肾小管的重吸收液和肺部交付。hPepT2的可靠模型生成的片段是基于同系物的结构解决乳糖通透酶花边和结构可以作为辅助数据。这样一个模型的交互能力探索75年对接的一组已知的配体。对接结果突显出丝毫的hPepT2高度疏水配体和离子相互作用的关键作用引起的界标。对接结果进一步验证了开发一个药效团模型,阐明所需的关键特性最优hPepT2亲和力和确认管理hPepT2 / hPepT1选择性的主要因素。对接的稳固性与药效基因映射结果和协议提出hPepT2模型提供一个令人鼓舞的验证,表明它可以方便地利用设计peptide-like分子转运一种改进的关联。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
氨苄青霉素	溶质载体家庭15成员2	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
青霉素	溶质载体家庭15成员2	蛋白质	人类	未知的	抑制剂	细节
头孢噻肟	溶质载体家庭15成员2	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
新青二	溶质载体家庭15成员2	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
阿莫西林	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	430000年	N /一个	N /一个	细节
氨苄青霉素	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	1300000	N /一个	N /一个	细节
青霉素	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	11000000	N /一个	N /一个	细节
氯氨苄青霉素	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	29000年	N /一个	N /一个	细节
Cefadroxil	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	3000年	N /一个	N /一个	细节
头孢噻吩	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	8300000	N /一个	N /一个	细节
头孢吡肟	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	11000000	N /一个	N /一个	细节
头孢克肟	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	2600000	N /一个	N /一个	细节
头孢美唑	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	4300000	N /一个	N /一个	细节
头孢噻肟	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	20000000	N /一个	N /一个	细节
头孢呋辛	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	12589254	N /一个	N /一个	细节
头孢呋辛	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	12600000	N /一个	N /一个	细节
头孢氨苄	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	75000年	N /一个	N /一个	细节
邻氯青霉素	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	950000年	N /一个	N /一个	细节
Cyclacillin	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	44000年	N /一个	N /一个	细节
双氯青霉素	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	420000年	N /一个	N /一个	细节
新青二	溶质载体家庭15成员2	Ki (nM)	3300000	N /一个	N /一个	细节