hERG K+通道的双态同源模型:在配体结合中的应用。

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李军，李志刚

hERG K+通道的双态同源模型:在配体结合中的应用。

生物组织医学化学杂志2005年3月15日;15(6):1737-41。

PubMed ID

15745831 (PubMed视图

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摘要

基于可用K+通道结构的同源模型已用于构建hERG心脏K+通道的多状态表示。这些状态用于捕获通道的灵活性。我们表明，为了正确地模拟一组不同配体的结合亲和力，这种灵活性是必不可少的。利用这种多状态方法，构建了一组已知hERG通道结合剂的结合亲和模型。预测值与实验结果吻合较好(RMSD: 0.56 kcal/mol)。此外，这些计算提供了与已发表的突变研究一致的结合配体结构。这些计算配体结合的复合物结构可用于指导具有较低hERG倾向的类似物的合成。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
阿司咪唑	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	0.91	N/A	N/A	细节
Bepridil	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	550	N/A	N/A	细节
氯丙嗪	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	1479	N/A	N/A	细节
Cisapride	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	6.5	N/A	N/A	细节
Halofantrine	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	200	N/A	N/A	细节
丙咪嗪	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	3388	N/A	N/A	细节
Perhexiline	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	7762	N/A	N/A	细节
号使用	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	18	N/A	N/A	细节
Sertindole	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	14	N/A	N/A	细节
Terfenadine	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	129	N/A	N/A	细节
甲硫哒嗪	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	35	N/A	N/A	细节
维拉帕米	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	145	N/A	N/A	细节