D-alanyl-D-alanine羧肽酶
细节
- 的名字
- D-alanyl-D-alanine羧肽酶
- 同义词
-
- 3.4.16.4
- DD-carboxypeptidase
- 基因名字
- 不可用
- 生物
- 链霉菌(菌株R61)
- 氨基酸序列
-
>拼箱| BSEQ0010942 | D-alanyl-D-alanine羧肽酶MVSGTVGRGTALGAVLLALLAVPAQAGTAAAADLPAPDDTGLQAVLHTALSQGAPGAMVR VDDNGTIHQLSEGVADRATGRAITTTDRFRVGSVTKSFSAVVLLQLVDEGKLDLDASVNT YLPGLLPDDRITVRQVMSHRSGLYDYTNDMFAQTVPGFESVRNKVFSYQDLITLSLKHGV TNAPGAAYSYSNTNFVVAGMLIEKLTGHSVATEYQNRIFTPLNLTDTFYVHPDTVIPGTH ANGYLTPDEAGGALVDSTEQTVSWAQSAGAVISSTQDLDTFFSALMSGQLMSAAQLAQMQ QWTTVNSTQGYGLGLRRRDLSCGISVYGHTGTVQGYYTYAFASKDGKRSVTALANTSNNV NVLNTMARTLESAFCGKPTTAKLRSATSSATTVERHEDIAPGIARD
- 残馀数
- 406
- 分子量
- 42916.725
- 理论π
- 6.03
- 去分类
-
功能丝氨酸型D-Ala-D-Ala羧肽酶活性流程细胞壁组织/肽聚糖生物合成工艺/细胞形状的调节组件细胞外区域
- 通用函数
- 丝氨酸型d-ala-d-ala羧肽酶活性
- 特定的功能
- 在壁肽聚糖合成的最后阶段催化不同的羧基肽化和转肽化反应。将β -内酰胺抗生素分子误认为正常底物(即d -丙氨酸- d -丙氨酸端肽)，它以一种长寿命的丝氨酸-酯连接的酰基酶的形式被固定，从而表现为青霉素结合蛋白(PBP)。
- Pfam域函数
-
- Beta-lactamase (PF00144）
- 跨膜区
- 不可用
- 细胞的位置
- 分泌
- 基因序列
-
>拼箱| BSEQ0002678 | 1221个基点ATGGTCTCAGGAACGGTGGGCAGAGGTACGGCGCTGGGCGCGGTGCTGTTGGCCCTCCTC GCAGTCCCCGCACAGGCCGGCACCGCCGCGGCCGCGGATCTGCCGGCACCCGACGACACC GGTCTGCAGGCGGTGCTGCACACGGCCCTTTCCCAGGGAGCCCCCGGTGCGATGGTGCGG GTCGACGACAACGGCACGATCCACCAGTTGTCGGAGGGAGTCGCCGACCGGGCCACCGGG CGTGCGATCACCACGACCGACCGGTTCCGCGTCGGCAGCGTCACCAAGAGCTTCTCCGCC GTGGTCCTGCTGCAACTGGTGGACGAGGGCAAGCTCGACCTGGACGCTTCGGTGAACACC TATCTGCCCGGGCTGCTGCCCGACGACCGGATCACCGTGCGTCAGGTGATGAGCCACCGCAGTGGGCTGTACGACTACACCAACGACATGTTCGCGCAGACGGTCCCGGGCTTCGAGTCC GTCCGCAACAAGGTCTTCAGCTACCAGGACCTGATCACCCTGTCCCTCAAGCACGGGGTC ACCAACGCACCGGGCGCGGCCTATTCATACTCCAACACGAACTTCGTCGTCGCGGGCATG CTCATCGAGAAGCTCACCGGCCACTCCGTGGCCACGGAGTACCAGAACCGCATCTTCACG CCGCTGAACCTGACCGACACCTTCTACGTGCACCCCGACACCGTCATCCCGGGCACCCAC GCCAACGGCTACCTCACGCCGGACGAGGCCGGTGGGGCCCTGGTCGACTCCACCGAGCAG ACGGTGTCGTGGGCGCAGAGCGCGGGCGCGGTCATCTCCAGCACGCAGGACCTGGACACG TTCTTCTCCGCGTTGATGAGCGGGCAGCTCATGTCCGCCGCGCAGCTCGCGCAGATGCAGCAGTGGACGACGGTCAACAGCACCCAGGGGTACGGCCTCGGCCTGCGCCGCCGTGACCTG TCCTGCGGTATCTCGGTGTACGGCCACACGGGCACCGTGCAGGGCTACTACACGTACGCC TTCGCCTCGAAGGACGGCAAGCGCAGCGTCACCGCGCTCGCCAACACCTCGAACAACGTG AACGTGCTGAACACGATGGCCCGCACGCTGGAATCCGCGTTCTGCGGCAAGCCGACGACC GCGAAGCTGCGCAGCGCGACCTCCTCGGCGACCACCGTGGAGCGCCACGAGGACATCGCG CCGGGTATCGCCCGCGACTGA
- 染色体的位置
- 不可用
- 轨迹
- 不可用
- 外部标识符
-
资源 链接 UniProtKB ID P15555 UniProtKB条目名称 DAC_STRSR GenBank蛋白ID 515050 基因库基因ID X05109 - 一般引用
-
- Duez C、Piron-Fraipont C、Joris B、Dusart J、Urdea MS、Martial JA、Frere JM、Ghuysen JM:链霉菌R61胞外dd -肽酶的初步结构。1.蓝链霉菌基因的克隆及核苷酸序列分析。生物化学学报。1987年2月2日;162(3):509-18。［文章］
- Duez C、Piron-Fraipont C、Joris B、Dusart J、Urdea MS、Martial JA、Frere JM、Ghuysen JM:链霉菌R61胞外dd -肽酶的初步结构。1.蓝链霉菌基因的克隆及核苷酸序列分析。欧洲生物化学杂志。1994 9月15日;224(3):1079。［文章］
- 王晓燕，王晓燕，王晓燕。链霉菌R61细胞外dd -肽酶的初步结构研究。2.氨基酸序列数据。生物化学学报。1987年2月2日;162(3):519-24。［文章］
- Piron-Fraipont C, Lenzini MV, Dusart J, Ghuysen JM:链霉菌R61中dd -肽酶/青霉素结合蛋白编码dac基因的转录分析:在分泌载体中使用启动子和信号序列。中华医学杂志1990年8月;223(1):114-20。［文章］
- Knox JR, Pratt RF:万古霉素和d -丙氨酸- d -丙氨酸肽酶结合细胞壁肽的不同模式和万古霉素抗性蛋白的可能作用。抗菌剂化学化学。1990年7月;34(7):1342-7。［文章］
- Kelly JA, Knox JR, Moews PC, Hite GJ, Bartolone JB, Zhao H, Joris B, Frere JM, ghysen JM:链霉菌R61中青霉素敏感d -丙酰羧基肽酶-转肽酶的结构及其与β -内酰胺的配合物。生物化学杂志1985年5月25日;260(10):6449-58。［文章］
- Kelly JA, Kuzin AP:一种dd -肽酶青霉素靶向酶在1.6 a分辨率下的细化晶体结构。中华分子生物学杂志。1995 11月24日;254(2):223-36。［文章］
- McDonough MA, Anderson JW, Silvaggi NR, Pratt RF, Knox JR, Kelly JA:两个动力学中间体的结构揭示了青霉素结合蛋白的物种特异性。中华分子生物学杂志。2002 9月6日;322(1):111-22。［文章］
- Silvaggi NR, Anderson JW, Brinsmade SR, Pratt RF, Kelly JA:膦酸抑制的D-Ala-D-Ala肽酶的晶体结构表现出类似于四面体过渡态的结构。生物化学。2003 Feb 11;42(5):1199-208。［文章］
- Silvaggi NR, Josephine HR, Kuzin AP, Nagarajan R, Pratt RF, Kelly JA: R61 dd -肽酶与肽甘类β -内酰胺之间的配合物晶体结构:一种具有“完美青霉素”的非共价配合物。中华分子生物学杂志2005 1月21日;345(3):521-33。［文章］
药物的关系
- 药物的关系
-
DrugBank ID 的名字 药物组 药理作用? 行动 细节 DB01786 D-Alanine 实验 未知的 细节 DB01868 (Glycyl-L-a-Aminopimelyl-E) - D-2-Aminoethyl膦酸酯 实验 未知的 细节 DB02136 头孢菌素模拟 实验 未知的 细节 DB02514 (2 z) 3 -{(氧化(含氧的)phosphoranyl)氧}2-phenylacrylate 实验 未知的 细节 DB02578 N - [(6 s) 6-carboxy-6 - (glycylamino)己酰]-D-alanyl-D-alanine 实验 未知的 细节 DB00456 头孢噻吩 批准，调查，批准 是的 抑制剂 细节 DB03313 头孢菌素C 实验 未知的 细节 DB03820 (2 s、5 r, 6 r) 6 - ({(6 s) 6 - [(Ammonioacetyl)氨基]6-carboxylatohexanoyl}氨基)3,3-dimethyl-7-oxo-4-thia-1-azabicyclo 3.2.0 heptane-2-carboxylate 实验 未知的 细节 DB03843 甲醛 批准,vet_approved 未知的 细节 DB03927 Glycyl-L-alpha-amino-epsilon-pimelyl-D-alanine 实验 未知的 细节 DB04340 2 - [(Dioxidophosphoranyl)氧]苯甲酸 实验 未知的 细节 DB04488 (6 s) - n - [(2 s, 3 r, 6 r, 7 r) 3 - (Acetyloxymethyl) 2-carboxy-8-oxo-5-thia-1-azabicyclo [4.2.0] octan-7-yl] 6 - [(2-aminoacetyl)氨基]7-hydroxy-7-oxoheptanimidate 实验 未知的 细节 DB03450 头孢菌素组 实验 未知的 细节