植物蛋白和哺乳动物蛋白的比较大规模表征揭示了相似和特殊的n - α -乙酰化特征。

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Bienvenut WV, Sumpton D, Martinez A, Lilla S, Espagne C, Meinnel T, Giglione C

植物蛋白和哺乳动物蛋白的比较大规模表征揭示了相似和特殊的n - α -乙酰化特征。

Mol Cell Proteomics, 2012 Jun;11(6):M111.015131。doi: 10.1074 / mcp.M111.015131。Epub 2012 1月5日。

PubMed ID
22223895 (PubMed视图
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摘要

n端修饰在蛋白质的活性、稳定性或亚细胞区隔化方面起着重要作用。在蛋白质组学研究中，这种修饰的描述和特征仍然很差，到目前为止，只有少数生物之间的比较研究可用。该领域的最新进展现在允许在蛋白质组全质谱分析过程中富集和选择n端肽。这些有针对性的方法揭示了蛋白质n端修饰的程度和性质。在这里，我们旨在研究模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中的这种修饰，并将这些结果与并行分析的人类样本得到的结果进行比较。我们应用了大规模分析，在两个数据集上编制了可靠的结论。我们的数据显示，动物和植物王国之间的特征修饰具有很强的收敛性，特别是蛋白质n端蛋氨酸切除、共翻译n - α -乙酰化或n -肉豆蔻酰化。由于底物和n - α -乙酰化机制的聚合，有可能在少数模式植物中鉴定出参与这种修饰的n -乙酰基转移酶。最后，高比例的核编码叶绿体蛋白在去除转运肽后具有成熟蛋白的翻译后n - α -乙酰化。与动物不同，植物具有细胞器靶向蛋白翻译后乙酰化的专用途径。 The corresponding machinery is yet to be discovered.

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
苯丙氨酸-tRNA连接酶α亚基 Q9Y285 细节
固醇-4-羧酸3-脱氢酶，脱羧 Q15738 细节
腺嘌呤phosphoribosyltransferase P07741 细节
-氨基己二半醛脱氢酶 P49419 细节
单羧酸转运蛋白8 P36021 细节
谷胱甘肽合成酶 P48637 细节
赖氨酸- tRNA连接酶 Q15046 细节
缬氨酸——tRNA连接酶 P26640 细节
色氨酸——tRNA连接酶，细胞质 P23381 细节
胆碱/乙醇胺激酶 Q9Y259 细节
嘌呤核苷磷酸化酶 P00491 细节
溶质载体家族12个成员2 P55011 细节
4-trimethylaminobutyraldehyde脱氢酶 P49189 细节
丙氨酸-tRNA连接酶，细胞质 P49588 细节
亚精胺合成酶 P19623 细节
钙调蛋白 P0DP23 细节
乳酸脱氢酶A链 P00338 细节
天门冬氨酸转氨酶，细胞质 P17174 细节
Dihydropteridine还原酶 P09417 细节
视网膜脱氢酶1 P00352 细节
Guanidinoacetate N-methyltransferase Q14353 细节
c -1-四氢叶酸合酶，细胞质 P11586 细节
ADP/ATP转位酶3 P12236 细节
ADP/ATP转位酶2 P05141 细节
法尼基焦磷酸合成酶 P14324 细节
谷胱甘肽s转移酶P P09211 细节
Perilipin-3 O60664 细节
L-xylulose还原酶 Q7Z4W1 细节
丝裂原活化蛋白激酶1 P28482 细节
脂肪酸合成酶 P49327 细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶A P62937 细节
胆碱转运体样蛋白1 Q8WWI5 细节
丝裂原活化蛋白激酶3 P27361 细节
Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase P11413 细节
Caspase-3 P42574 细节
rc - β丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 P31751 细节
14-3-3蛋白质zeta/delta P63104 细节
脂肪酸结合蛋白，脂肪细胞 P15090 细节
脂肪酸结合蛋白，心脏 P05413 细节
m7GpppX diphosphatase Q96C86 细节
双功能嘌呤生物合成蛋白PURH P31939 细节
胸苷激酶，胞质 P04183 细节
乙酰辅酶a乙酰转移酶，胞质 Q9BWD1 细节
Uroporphyrinogen脱羧酶 P06132 细节
白三烯A-4水解酶 P09960 细节
二磷酸果糖醛缩酶A P04075 细节
Caspase-7 P55210 细节
巨噬细胞迁移抑制因子 P14174 细节
硫氧还蛋白还原酶1，细胞质 Q16881 细节
脂肪酸结合蛋白，表皮 Q01469 细节
Serpin B6 P35237 细节
丝氨酸dehydratase-like Q96GA7 细节
多功能蛋白ADE2 P22234 细节
CAD蛋白质 P27708 细节
谷氨酰胺,tRNA连接酶 P47897 细节
N-acetyl-D-glucosamine激酶 Q9UJ70 细节
烟酰胺phosphoribosyltransferase P43490 细节
nadd依赖蛋白去乙酰化酶sirtuin-1 Q96EB6 细节
电压依赖性阴离子选择通道蛋白1 P21796 细节
缺氧诱导因子1- α抑制剂 Q9NWT6 细节
双功能3'-磷酸腺苷5'-磷酸硫酸合成酶 O43252 细节
Calpain-1催化亚基 P07384 细节
camp依赖性蛋白激酶ii型α调节亚基 P13861 细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基 P10644 细节
信号换能器和转录激活子3 P40763 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2A 65 kDa调节亚基A α亚型 P30153 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶2A 55 kDa调节亚基B α亚型 P63151 细节
adp核糖化因子1 P84077 细节
60S核糖体蛋白L13a P40429 细节
60S核糖体蛋白L11 P62913 细节
蛋白酶体亚单位α -3型 P25788 细节
蛋白酶体亚单位β -3型 P49720 细节
蛋白酶体亚基-4型 P28070 细节
血小板活化因子乙酰水解酶IB亚基γ Q15102 细节
Profilin-1 P07737 细节
钙蛋白酶小亚基1 P04632 细节
Destrin P60981 细节
Cofilin-1 P23528 细节
延伸系数2 P13639 细节
Profilin-2 P35080 细节
酰基辅酶A硫酯酶 Q9NPJ3 细节
母亲反对十肢瘫痪同源物2 Q15796 细节
蛋白质精氨酸n -甲基转移酶 O60678 细节
Galectin-1 P09382 细节
Glycogenin-1 P46976 细节
信号识别粒子14kda蛋白 P37108 细节
Poly(A)聚合酶 P51003 细节
v型质子atp酶亚基c1 P21283 细节
gtp结合核蛋白Ran P62826 细节
过渡内质网atp酶 P55072 细节
谱蛋白链，非红细胞性1 Q01082 细节
剪接RNA解旋酶DDX39B Q13838 细节
Peroxiredoxin-6 P30041 细节
断点簇区蛋白 P11274 细节
丝氨酸蛋白激酶ATM Q13315 细节
肌动蛋白，细胞质1 P60709 细节
肌动蛋白，细胞质2 P63261 细节
肌动蛋白，主动脉平滑肌 P62736 细节
组蛋白H1.4 P10412 细节
氯离子胞内通道蛋白1 O00299 细节
程序性细胞死亡蛋白6 O75340 细节
细胞色素c氧化酶铜伴侣 Q14061 细节
Calmodulin-2 P0DP24 细节
Calmodulin-3 P0DP25 细节
蛋白质S100-A8 P05109 细节
异质核核糖核蛋白H P31943 细节
活化蛋白C激酶受体 P63244 细节
Stress-induced-phosphoprotein 1 P31948 细节
Serpin B9 P50453 细节
Cystatin-B P04080 细节
剪接因子3B亚基3 Q15393 细节
异质核核糖核蛋白F P52597 细节
热休克蛋白105 kDa Q92598 细节
剪接因子3A亚基3 Q12874 细节
肿瘤蛋白D54 O43399 细节
原肌凝蛋白-4链 P67936 细节
结plakoglobin P14923 细节
远上游元件结合蛋白2 Q92945 细节
Ras gtp酶激活样蛋白IQGAP1 P46940 细节
Nucleophosmin P06748 细节
40S核糖体蛋白S18 P62269 细节
40S核糖体蛋白S5 P46782 细节
拼接因子1 Q15637 细节
生存运动神经元蛋白 B4DP61 细节
干扰素诱导的双链rna激活蛋白激酶 P19525 细节
丝裂原活化蛋白激酶3 Q8IVH8 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶Nek9 Q8TD19 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1 O95747 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 2 Q13177 细节
磷脂酰肌醇5-磷酸4-激酶2型β P78356 细节
丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PRP4同源物 Q13523 细节
Thiamine-triphosphatase Q9BU02 细节
超长链脂肪酸伸长蛋白1 Q9BW60 细节
酪氨酸蛋白磷酸酶非受体12型 Q05209 细节
戊烯基转移酶结构域含蛋白1 Q9Y5Z9 细节
信号换能器和转录激活因子1- α / β P42224 细节
组蛋白乙酰转移酶p300 Q09472 细节