大肠埃希菌K-12的全基因组序列。

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Blattner FR, Plunkett G 3rd, Bloch CA, Perna NT, Burland V, Riley M, Collado-Vides J, Glasner JD, Rode CK, Mayhew GF, Gregor J, Davis NW, Kirkpatrick HA, Goeden MA, Rose DJ, Mau B, Shao Y

大肠埃希菌K-12的全基因组序列。

科学，1997年9月5日;277(5331):1453-62。

PubMed ID

9278503 (PubMed视图

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摘要

给出了大肠埃希菌K-12的4639221个碱基对序列。在已标注的4288个蛋白质编码基因中，38%没有归属功能。与其他五种测序微生物的比较揭示了无处不在和狭窄分布的基因家族;大肠杆菌中许多相似基因家族也很明显。最大的副同源蛋白家族包含80个ABC转运蛋白。基因组作为一个整体，在局部复制方向上有着惊人的组织;鸟嘌呤，寡核苷酸可能与复制和重组有关，大多数基因都是这样定向的。基因组还包含插入序列(IS)元件，噬菌体残余物和许多其他不寻常的组成斑块，表明基因组通过水平转移具有可塑性。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
30S核糖体蛋白S4	P0A7V8	细节
苹果酸脱氢酶	P61889	细节
D-lactate脱氢酶	P06149	细节
进化出半乳糖苷酶亚单位	P06864	细节
双功能蛋白FolC	P08192	细节
30S核糖体蛋白S9	P0A7X3	细节
30S核糖体蛋白S10	P0A7R5	细节
dna定向RNA聚合酶亚基β	P0A8V2	细节
30S核糖体蛋白S12	P0A7S3	细节
谷胱甘肽还原酶	P06715	细节
dna定向RNA聚合酶亚单位	P0A7Z4	细节
UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	P0A749	细节
青霉素结合蛋白1B	P02919	细节
DNA聚合酶I	P00582	细节
富马酸还原酶黄蛋白亚基	P00363	细节
3-oxoacyl-[酰基载体蛋白]合成酶3	P0A6R0	细节
青霉素结合蛋白1A	P02918	细节
氨基脱氧chorisate合成酶组分1	P05041	细节
氧不敏感NADPH硝化还原酶	P17117	细节
d -丙氨酸- d -丙氨酸连接酶A	P0A6J8	细节
d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacB	P24228	细节
丙酮酸脱氢酶[泛醌]	P07003	细节
DNA拓扑异构酶4亚基A	P0AFI2	细节
DNA旋回酶亚基B	P0AES6	细节
3-氧酰-[酰基载体蛋白]合成酶2	P0AAI5	细节
3-oxoacyl-[酰基载体蛋白]合成酶1	P0A953	细节
Dihydropteroate合酶	P0AC13	细节
[柠檬酸[pro-3S]裂解酶]连接酶	P77390	细节
苹果酸合成酶G	P37330	细节
天冬氨酸转氨酶	P00509	细节
伯胺氧化酶	P46883	细节
尿苷磷酸化酶	P12758	细节
ATP phosphoribosyltransferase	P60757	细节
Dephospho-CoA激酶	P0A6I9	细节
腺苷酸激酶	P69441	细节
异柠檬酸脱氢酶	P08200	细节
3-酮- l -古酸酯-6-磷酸脱羧酶	P39304	细节
UDP-N-acetylmuramoylalanine——D-glutamate连接酶	P14900	细节
2-methylisocitrate裂合酶	P77541	细节
依赖于atp的去硫生物素合成酶BioD	P13000	细节
2, 3-diketo-L-gulonate还原酶	P37672	细节
泛酸酯激酶	P0A6I3	细节
ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase	P67910	细节
信号肽酶I	P00803	细节
Ferrichrome-iron受体	P06971	细节
腐蛋白结合质周蛋白	P31133	细节
NH(3)依赖型NAD(+)合成酶	P18843	细节
-海藻糖-磷酸合成酶[udp形成]	P31677	细节
氨通道	P69681	细节
L-asparaginase 2	P00805	细节
Beta-lactamase	P00811	细节
脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶	P06968	细节
假定的羟丙酮酸异构酶YgbM	Q46891	细节
铁(3+)-羟肟酸结合蛋白FhuD	P07822	细节
3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	P0A6D3	细节
α -酮戊二酸依赖性牛磺酸双加氧酶	P37610	细节
Histidinol-phosphate转氨酶	P06986	细节
半乳糖苷O-acetyltransferase	P07464	细节
Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase	Q46822	细节
Galactose-1-phosphate uridylyltransferase	P09148	细节
苷酶	P00722	细节
谷氨酰胺-果糖-6-磷酸转氨酶[异构化]	P17169	细节
UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase	P27828	细节
抗热的gluconokinase	P46859	细节
Thymidylate合酶	P0A884	细节
Adenylosuccinate合成酶	P0A7D4	细节
甲酸脱氢酶H	P07658	细节
2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase	P26281	细节
Dihydroorotase	P05020	细节
udp - n -乙酰氨基葡萄糖转移酶n -乙酰muramyl-(五肽)焦磷酸-十一烯醛n -乙酰氨基葡萄糖转移酶	P17443	细节
吡哆胺激酶	P77150	细节
维生素B12转运蛋白	P06129	细节
肽deformylase	P0A6K3	细节
Phosphoribosylglycinamide formyltransferase	P08179	细节
维生素b12结合蛋白	P37028	细节
脱氧胞苷三磷酸脱氨酶	P28248	细节
Chorismate pyruvate-lyase	P26602	细节
4-氨基丁酸转氨酶	P22256	细节
半胱氨酸desulfurase	P77444	细节
法尼基二磷酸合成酶	P22939	细节
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate转氨酶	P12995	细节
8-oxo-dGTP diphosphatase	P08337	细节
二氢柠檬酸脱氢酶(醌)	P0A7E1	细节
蛋氨酸,tRNA连接酶	P00959	细节
UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate——2,6-diaminopimelate连接酶	P22188	细节
吡哆醇5'-磷酸合成酶	P0A794	细节
乙醇脱氢酶YqhD	Q46856	细节
磷酸核糖基甘氨酸酰胺甲酰转移酶2	P33221	细节
嘌呤核苷磷酸化酶	P45563	细节
色氨酸合成蛋白TrpCF	P00909	细节
DNA错配修复蛋白MutL	P23367	细节
外膜蛋白F	P02931	细节
1-脱氧-d -木酮糖5-磷酸还原异构酶	P45568	细节
膜结合溶髓蛋白转糖基酶B	P41052	细节
4-hydroxythreonine-4-phosphate脱氢酶	P19624	细节
Gamma-aminobutyraldehyde脱氢酶	P77674	细节
Acetylglutamate激酶	P0A6C8	细节
依赖atp的DNA解旋酶RecQ	P15043	细节
Methylmalonyl-CoA脱羧酶	P52045	细节
蛋白质YceI	P0A8X2	细节
胞嘧啶核苷酸激酶	P0A6I0	细节
Allantoate酰胺水解酶	P77425	细节
甘油激酶	P0A6F3	细节
长链脂肪酸运输蛋白	P10384	细节
蛋氨酸合成酶	P13009	细节
氧不敏感NAD(P)H硝化还原酶	P38489	细节
Glucosamine-6-phosphate脱氨酶	P0A759	细节
甜椒酰[酰基载体蛋白]甲酯酯酶	P13001	细节
Tautomerase项目前期技术援助	P31992	细节
Xaa-Pro氨基肽酶	P15034	细节
dna -3-甲基腺苷糖基化酶	P05100	细节
hth型转录调节因子MalT	P06993	细节
2- c -甲基- d -赤藓糖醇4-磷酸胞基转移酶	Q46893	细节
糖磷酸酶YbiV	P75792	细节
d -异糖酶结合质周蛋白	P39265	细节
左卡尼汀CoA-transferase	P31572	细节
奥罗替丁5'-磷酸脱羧酶	P08244	细节
l -阿拉伯糖结合质周蛋白	P02924	细节
钼辅助因子鸟苷基转移酶	P32173	细节
麦芽糊精磷酸化酶	P00490	细节
Glucose-1-phosphatase	P19926	细节
UDP-galactopyranose变位酶	P37747	细节
生物素合成酶	P12996	细节
谷氨酸,半胱氨酸连接酶	P0A6W9	细节
甲酸乙酰转移酶1	P09373	细节
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase	P31057	细节
Histidinol脱氢酶	P06988	细节
Argininosuccinate合酶	P0A6E4	细节
甘露糖水解酶	P32056	细节
胆色素原脱氨酶	P06983	细节
双功能蛋白PutA	P09546	细节
双功能多粘菌素抗性蛋白ArnA	P77398	细节
8-amino-7-oxononanoate合酶	P12998	细节
组氨酸,tRNA连接酶	P60906	细节
Deoxyribose-phosphate醛缩酶	P0A6L0	细节
Isoaspartyl二肽酶	P39377	细节
N,N'-二乙酰壳聚糖特异性磷酸转移酶IIB组分	P69795	细节
多药外排泵亚单位AcrB	P31224	细节
磷酸烯醇丙酮酸羧化酶	P00864	细节
Diaminopimelate脱羧酶	P00861	细节
胞嘧啶脱氨酶	P25524	细节
铁(3+)dictrate转运蛋白FecA	P13036	细节
hth型转录调节因子TreR	P36673	细节
N-succinylarginine dihydrolase	P76216	细节
鸟氨酸氨甲酰转移酶链I	P04391	细节
Rhamnulose-1-phosphate醛缩酶	P32169	细节
L-rhamnose异构酶	P32170	细节
碱性磷酸酶	P00634	细节
亚硫酸盐还原酶[NADPH]血蛋白β组分	P17846	细节
UDP-glucose 4-epimerase	P09147	细节
GDP-L-焦点合酶	P32055	细节
富马酸水合酶II类	P05042	细节
Alpha-xylosidase	P31434	细节
莽草酸脱氢酶(NADP +)	P15770	细节
外膜蛋白TolC	P02930	细节
乳糖透性酶	P02920	细节
核糖导入结合蛋白RbsB	P02925	细节
DNA拓扑异构酶	P06612	细节
附庸水合酶B	P36683	细节
2,4-二烯酰辅酶a还原酶[NADPH]	P42593	细节
脂质A棕榈酰转移酶PagP	P37001	细节
4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate还原酶	P04036	细节
二价阳离子耐受蛋白CutA	P69488	细节
胸苷磷酸化酶	P07650	细节
麦芽糖结合质周蛋白	P0AEX9	细节
Ribokinase	P0A9J6	细节
7-alpha-hydroxysteroid脱氢酶	P0AET8	细节
氨乙酰丙酸脱水酶	P0ACB2	细节
丙酮酸脱氢酶E1组分	P0AFG8	细节
磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚酸醛缩酶，磷敏感	P0AB91	细节
青霉素不敏感穆林内肽酶	P0C0T5	细节
烯酰-[酰基载体-蛋白质]还原酶[NADH] FabI	P0AEK4	细节
5 ' -methylthioadenosine / S-adenosylhomocysteine核苷酶	P0AF12	细节
黄嘌呤phosphoribosyltransferase	P0A9M5	细节
二氢叶酸还原酶	P0ABQ4	细节
嘌呤核苷磷酸化酶deod型	P0ABP8	细节
甲硫氨酸氨肽酶	P0AE18	细节
camp激活的全球转录调节因子CRP	P0ACJ8	细节
酰基辅酶a硫酯酶I	P0ADA1	细节
Branched-chain-amino-acid转氨酶	P0AB80	细节
B类酸性磷酸酶	P0AE22	细节
可溶性溶木素转糖基酶	P0AGC3	细节
辅酶A生物合成双功能蛋白CoaBC	P0ABQ0	细节
二磷酸果糖醛缩酶2类	P0AB71	细节
磷酸结合蛋白PstS	P0AG82	细节
趋化蛋白CheY	P0AE67	细节
双功能蛋白GlmU	P0ACC7	细节
AMP核苷酶	P0AE12	细节
细胞色素c - 552	P0ABK9	细节
ATP合酶亚基b	P0ABA0	细节
酪氨酸- tRNA连接酶	P0AGJ9	细节
亚精胺/腐胺结合的质周蛋白	P0AFK9	细节
l -藻糖糖磷酸醛缩酶	P0AB87	细节
核糖体小亚基伪尿苷合成酶A	P0AA43	细节
胞嘧啶核苷脱氨酶	P0ABF6	细节
Glucarate脱水酶	P0AES2	细节
甘油吸收促进蛋白	P0AER0	细节
酰基辅酶a硫酯酶	P0AGG2	细节
阿拉伯糖操纵子调节蛋白	P0A9E0	细节
单链dna结合蛋白	P0AGE0	细节
磷脂酶A1	P0A921	细节
Amidophosphoribosyltransferase	P0AG16	细节
外膜蛋白A	P0A910	细节
甘氨酸甜菜碱结合质周蛋白	P0AFM2	细节
过氧化氢诱导基因激活剂	P0ACQ4	细节
外膜蛋白X	P0A917	细节
2-氨基-3-酮丁酸辅酶A连接酶	P0AB77	细节
释放因子谷氨酰胺甲基转移酶	P0ACC1	细节
Lactaldehyde还原酶	P0A9S1	细节
d -塔哥糖-1,6-二磷酸醛缩酶亚基KbaY	P0AB74	细节
甘油醛-3-磷酸脱氢酶A	P0A9B2	细节
d -半乳糖结合质周蛋白	P0AEE5	细节
核苷特异性通道形成蛋白tsx	P0A927	细节
谷胱甘肽s转移酶	P0A9D2	细节
d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacA	P0AEB2	细节
5, 10-methylenetetrahydrofolate还原酶	P0AEZ1	细节
吡哆醇/吡哆沙明5'-磷酸氧化酶	P0AFI7	细节
硫氧还蛋白还原酶	P0A9P4	细节
3-氧酰基-[酰基载体蛋白]还原酶FabG	P0AEK2	细节
脂蛋白NlpI	P0AFB1	细节
硫醇:二硫交换蛋白DsbC	P0AEG6	细节
2-iminobutanoate / 2-iminopropanoate脱氨酶	P0AF93	细节
KHG / KDPG醛缩酶	P0A955	细节
天冬氨酸ammonia-lyase	P0AC38	细节
渗透压传感器蛋白EnvZ	P0AEJ4	细节
次黄嘌呤phosphoribosyltransferase	P0A9M2	细节
可能是丙酮酸黄氧还蛋白氧化还原酶	P52647	细节
肽聚糖合成酶FtsI	P0AD68	细节
DNA聚合酶III亚单位	P03007	细节
GMP合成酶[谷氨酰胺水解]	P04079	细节
乳糖操纵子阻滞剂	P03023	细节
FMN-dependent NADH-azoreductase	P41407	细节
可能是磷酸酶YcdX	P75914	细节
谷氨酰胺酶1	P77454	细节
钼铜素合成酶催化亚基	P30749	细节
ADP化合物水解酶	P45799	细节
o-succinylbenzoate合酶	P29208	细节
葡糖激酶	P0A6V8	细节
腺嘌呤DNA糖化酶	P17802	细节
漆酶域蛋白YfiH	P33644	细节
推定甘露醇-3-磷酸甘油酸磷酸酶	P76329	细节
3-mercaptopyruvate sulfurtransferase	P31142	细节
DNA聚合酶III亚单位tau	P06710	细节
Flavohemoprotein	P24232	细节
Ecotin	P23827	细节
亚硫酸盐还原酶[NADPH]黄蛋白α组分	P38038	细节
Deoxyribodipyrimidine photo-lyase	P00914	细节
L-aspartate氧化酶	P10902	细节
UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine还原酶	P08373	细节
烷基过氧化氢还原酶亚基F	P35340	细节
铁氧还蛋白——辅酶ii还原酶	P28861	细节
蛋白质UshA	P07024	细节
Flavodoxin-1	P61949	细节
氧化还原酶YdhF	P76187	细节
谷氨酸脱羧酶	P69908	细节
Aminodeoxychorismate裂合酶	P28305	细节
33kda伴侣蛋白	P0A6Y5	细节
游离蛋氨酸- r -亚砜还原酶	P76270	细节
O-acetyl-ADP-ribose脱乙酰酶	P0A8D6	细节
二磷酸核糖核苷还原酶1亚基β	P69924	细节
胱硫醚gamma-synthase	P00935	细节
Maltoporin	P02943	细节
RNA 3'端磷酸环化酶	P46849	细节
转酮醇酶1	P27302	细节
传感蛋白PhoQ	P23837	细节
DNA拓扑异构酶4亚基B	P20083	细节
钾运输atp酶- atp结合亚基	P03960	细节
核黄素合酶	P0AFU8	细节
天冬氨酸氨甲酰转移酶催化亚基	P0A786	细节
琥珀酸脱氢酶黄蛋白亚基	P0AC41	细节
双功能连接酶/抑制物BirA	P06709	细节
多顺-十一烯基-二磷酸合成酶((2E,6E)-法尼基-二磷酸)	P60472	细节
青霉素结合蛋白2	P0AD65	细节
50S核糖体蛋白L4	P60723	细节
d -丙氨酰- d -丙氨酸羧肽酶DacC	P08506	细节
dna定向RNA聚合酶亚基β '	P0A8T7	细节
30S核糖体蛋白S14	P0AG59	细节
30S核糖体蛋白S13	P0A7S9	细节
30S核糖体蛋白S19	P0A7U3	细节
青霉素结合蛋白1C	P76577	细节
DNA聚合酶III亚基β	P0A988	细节
呼吸硝酸还原酶1 α链	P09152	细节
呼吸硝酸还原酶1链	P11349	细节
呼吸硝酸还原酶1 γ链	P11350	细节
水通道蛋白Z	P60844	细节
琥珀酸脱氢酶铁硫亚基	P07014	细节
琥珀酸脱氢酶细胞色素b556亚基	P69054	细节
琥珀酸脱氢酶疏水膜锚亚基	P0AC44	细节
菱形蛋白酶GlpG	P09391	细节
外膜蛋白G	P76045	细节
富马酸还原酶铁硫亚基	P0AC47	细节
富马酸还原酶亚基C	P0A8Q0	细节
富马酸还原酶亚基D	P0A8Q3	细节
外膜蛋白W	P0A915	细节
细胞分裂蛋白ZipA	P77173	细节
atp依赖性Clp蛋白酶的蛋白水解亚基	P0A6G7	细节
3-hydroxydecanoyl -酰基载体蛋白质脱水酶	P0A6Q3	细节
蛋白质TonB	P02929	细节
Ribosome-recycling因素	P0A805	细节
4-羟基-3-甲基-2-烯基二磷酸还原酶	P62623	细节
tRNA dimethylallyltransferase	P16384	细节
Lactaldehyde脱氢酶	P25553	细节
Methionyl-tRNA formyltransferase	P23882	细节
可能是l -抗坏血酸-6-磷酸内酯酶UlaG	P39300	细节
2- c -甲基- d -赤藓糖醇2,4-环二磷酸合酶	P62617	细节
甲酸脱氢酶，硝酸盐诱导，主要亚基	P24183	细节
硝酸诱导的甲酸脱氢酶，铁-硫亚基	P0AAJ3	细节
甲酸脱氢酶，硝酸盐诱导，细胞色素b556(Fdn)亚基	P0AEK7	细节
调节蛋白SdiA	P07026	细节
酰基载体蛋白	P0A6A8	细节
生物素羧化酶	P24182	细节
大肠杆菌素I受体	P17315	细节
可能是n -乙酰神经氨酸外膜通道蛋白NanC	P69856	细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶A	P0AFL3	细节
脂肪酸代谢调节蛋白	P0A8V6	细节
外膜脂蛋白LolB	P61320	细节
Leucyl / phenylalanyl-tRNA——蛋白转移酶	P0A8P1	细节
氨肽酶N	P04825	细节
p蛋白质	P0A9J8	细节
镍结合质周蛋白	P33590	细节
硫醇:二硫交换蛋白DsbA	P0AEG4	细节
二硫键形成蛋白B	P0A6M2	细节
D-alanyl-D-alanine肽链内切酶	P0AFI5	细节
50S核糖体蛋白L16	P0ADY7	细节
30S核糖体蛋白S3	P0A7V3	细节
30S核糖体蛋白S8	P0A7W7	细节
30S核糖体蛋白S7	P02359	细节
DNA旋回酶亚单位A	P0AES4	细节
中链脂肪酸——CoA连接酶	P38135	细节
儿茶酚铁载体受体Fiu	P75780	细节
外膜孔	P06996	细节
依赖于atp的DNA解旋酶DinG	P27296	细节
DNA聚合酶IV	Q47155	细节
UvrABC系统蛋白A	P0A698	细节
细胞膜蛋白YdjM	P64481	细节
冷休克蛋白CspA	P0A9X9	细节
蛋白质RecA	P0A7G6	细节