肽deformylase

细节

的名字

肽deformylase

同义词

• 3.5.1.88
• fms
• PDF
• 多肽deformylase

基因名字

def

生物

大肠杆菌(应变K12)

氨基酸序列

>拼箱| BSEQ0011040 |肽deformylase MSVLQVLHIPDERLRKVAKPVEEVNAEIQRIVDDMFETMYAEEGIGLAATQVDIHQRIIV IDVSENRDERLVLINPELLEKSGETGIEEGCLSIPEQRALVPRAEKVKIRALDRDGKPFE LEADGLLAICIQHEMDHLVGKLFMDYLSPLKQQRIRQKVEKLDRLKARA

数量的残留物

169年

分子量

19328.23

理论π

5.0

去分类

功能

二价铁绑定/水解酶活性/肽deformylase活动/核糖体绑定/锌离子结合

流程

co-translational蛋白质改性/氨基蛋白氨基酸修改/翻译

组件

胞质

通用函数

锌离子结合

特定的功能

删除从氨基甲酰集团遇到的新合成的蛋白质。至少需要一个二肽的高效反应速率。氨基端L-methionine是活动的先决条件,但酶广泛的特异性在其他位置。

域包含了函数

• Pep_deformylase (PF01327)

跨膜区

不可用

细胞的位置

胞质

基因序列

>拼箱| BSEQ0011041 |肽deformylase (def) ATGTCAGTTTTGCAAGTGTTACATATTCCGGACGAGCGGCTTCGCAAAGTTGCTAAACCG GTAGAAGAAGTGAATGCAGAAATTCAGCGTATCGTCGATGATATGTTCGAGACGATGTAC GCAGAAGAAGGTATTGGCCTGGCGGCAACCCAGGTTGATATCCATCAACGTATCATTGTT ATTGATGTTTCGGAAAACCGTGACGAACGGCTAGTGTTAATCAATCCAGAGCTTTTAGAA AAAAGCGGCGAAACAGGCATTGAAGAAGGTTGCCTGTCGATCCCTGAACAACGTGCTTTA GTGCCGCGCGCAGAGAAAGTTAAAATTCGCGCCCTTGACCGCGACGGTAAACCATTTGAA CTGGAAGCAGACGGTCTGTTAGCCATCTGTATTCAGCATGAGATGGATCACCTGGTCGGC AAACTGTTTATGGATTATCTGTCACCGCTGAAACAACAACGTATTCGTCAGAAAGTTGAA AAACTGGATCGTCTGAAAGCCCGGGCTTAA

染色体的位置

不可用

轨迹

不可用

外部标识符

资源	链接
UniProtKB ID	P0A6K3
UniProtKB条目名称	DEF_ECOLI
基因库蛋白质ID	471304年
基因库基因身份证	X77800

一般引用

1. 好运气D基因年代,Marliere P:遗传特性的多肽deformylase eubacterial翻译的一种独特的酶。EMBO j . 1994年2月15日,13(4):914 - 23所示。(文章]
2. Guillon JM, Mechulam Y, Schmitter JM, Blanquet年代,Fayat G:基因的中断Met-tRNA (fMet) formyltransferase严重损害大肠杆菌的生长。J Bacteriol。1992年7月,174 (13):4294 - 301。(文章]
3. 布拉特纳FR,冷藏室G 3日,布洛赫CA,佩纳NT, Burland V,莱利M, Collado-Vides J, Glasner JD, CK,梅休GF,格雷戈尔J,戴维斯NW,柯克帕特里克哈,Goeden妈,玫瑰DJ,茂B,邵Y:大肠杆菌k - 12的完整基因组序列。科学。1997年9月5日,277 (5331):1453 - 62。(文章]
4. Hayashi K, Morooka N,山本Y, Fujita K, Isono K,崔年代,大坪E,巴巴T,万纳提单,Mori H, Horiuchi T:高度准确的大肠杆菌基因组序列的K - 12株MG1655 W3110。摩尔系统杂志。2006;2:2006.0007。Epub 2006年2月21日。(文章]
5. Meinnel T, Guillon JM, Mechulam Y, Blanquet S:大肠杆菌fmt基因,编码methionyl-tRNA (fMet) formyltransferase逃代谢控制。J Bacteriol。1993年2月,175 (4):993 - 1000。(文章]
6. Meinnel T, Blanquet S:酶的大肠杆菌肽deformylase的属性。J Bacteriol。1995年4月,177 (7):1883 - 7。(文章]
7. Groche D,贝克,是我,Kabsch W,舒尔茨年代,瓦格纳房颤:隔离和结晶功能主管大肠杆菌肽deformylase形式包含铁或镍活性部位。生物化学Biophys Res Commun。1998年5月19日,246 (2):342 - 6。(文章]
8. Meinnel T, Blanquet年代,Dardel F:一个新的子类的锌metalloproteases总科肽deformylase结构显示的解决方案。J杂志。1996年9月27日,262 (3):375 - 86。(文章]
9. Dardel F,拉古萨年代,Lazennec C, Blanquet年代,Meinnel T:方案结构nickel-peptide deformylase。J杂志。1998年7月17日,280(3):501 - 13所示。(文章]
10. 陈可,龚W, Rajagopalan PT,郝B,蔡厘米,裴D:大肠杆菌肽deformylase的晶体结构。生物化学。1997年11月11日,36 (45):13904 - 9。(文章]
11. 贝克,是我,Kabsch W,舒尔茨年代,瓦格纳房颤:肽deformylase结构和底物结合位点的识别。生物化学杂志。1998年5月8日,273 (19):11413 - 6。(文章]
12. 贝克,是我,Kabsch W, Groche D,舒尔茨年代,瓦格纳房颤:铁中心,底物识别和肽deformylase机制。Nat结构生物学观点》1998年12月,5 (12):1053 - 8。(文章]
13. 郝B,龚W, Rajagopalan PT,周Y,裴D,陈可:抗生素的结构基础设计目标肽deformylase。生物化学。1999年4月13日,38 (15):4712 - 9。(文章]

药物的关系

药物的关系

DrugBank ID	的名字	药物组	药理作用?	行动	细节
DB01942	甲酸	实验,试验	未知的		细节
DB02276	(S) 2 - (Phosphonoxy) Caproyl-L-Leucyl-P-Nitroanilide	实验	未知的		细节
DB04310	2 - [(Formyl-Hydroxy-Amino)甲基][1 - (2-Hydroxymethyl-Pyrrolidine-1-Carbonyl) 2-methyl-propyl]庚酸酰胺	实验	未知的		细节
DB04368	bb - 3497	实验	未知的		细节
DB08523	(羟基(3-PHENYLPROPYL)氨基)甲醇	实验	未知的		细节