信号网络中的全局、体内和位点特异性磷酸化动态。

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Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M

信号网络中的全局、体内和位点特异性磷酸化动态。

细胞。2006年11月3日;127(3):635-48。

PubMed ID
17081983 (在PubMed
］
摘要

细胞信号机制通常通过翻译后蛋白修饰来传递信息，最重要的是可逆蛋白磷酸化。在这里，我们开发并应用了一种通用的质谱技术，以识别和定量磷酸化位点作为刺激、时间和亚细胞位置的函数。我们在2244个蛋白质上检测了6600个磷酸化位点，并测定了其在表皮生长因子(EGF)刺激HeLa细胞后的时间动态，并将其记录在Phosida数据库中。14%的磷酸化位点至少被EGF调节2倍，这些位点是根据它们的时间分布进行分类的。令人惊讶的是，大多数蛋白质含有多个磷酸化位点，表现出不同的动力学，这表明它们是整合信号的平台。除了蛋白激酶级联外，可逆磷酸化的靶标还包括泛素连接酶、鸟嘌呤核苷酸交换因子和至少46种不同的转录调节因子。动态磷蛋白组提供了一个缺失的环节，在一个整体的细胞调控的观点。

引用本文的药库数据

多肽
的名字 UniProt ID
酪氨酸受体激酶ABL1 P00519 细节
丙酮酸激酶11 P14618 细节
DNA连接酶3 P49916 细节
Monocarboxylate运输机7 O15403 细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶 P07814 细节
DNA连接酶1 P18858 细节
中性氨基酸转运蛋白B(0) Q15758 细节
铁蛋白重链 P02794 细节
RAC-alpha丝氨酸/ threonine-protein激酶 P31749 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶A-Raf P10398 细节
Monocarboxylate运输车4 O15427 细节
酪氨酸蛋白激酶受体erbB-2 P04626 细节
Chromodomain-helicase-DNA-binding蛋白1 O14646 细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶 P04406 细节
丙酮酸脱氢酶E1组分α亚基，体细胞形态，线粒体 P08559 细节
Choline-phosphate cytidylyltransferase一 P49585 细节
乙酰辅酶a羧化酶1 Q13085 细节
胞质磷脂酶A2 P47712 细节
Monocarboxylate转运体1 P53985 细节
Inosine-5”一磷酸脱氢酶2 P12268 细节
血红素加氧酶1 P09601 细节
DNA拓扑异构酶2α P11388 细节
表皮生长因子受体 P00533 细节
激活CDC42激酶1 Q07912 细节
多药耐药相关蛋白1 P33527 细节
CTP合酶1 P17812 细节
DNA甲基转移酶1 (cytosine-5) P26358 细节
Calpastatin P20810 细节
生长因子受体结合蛋白2 P62993 细节
C-X-C趋化因子受体 P61073 细节
丝裂原激活蛋白激酶1 P28482 细节
DNA拓扑异构酶1 P11387 细节
胰岛素受体底物1 P35568 细节
连环蛋白beta 1 P35222 细节
Calnexin P27824 细节
丝裂原激活蛋白激酶3 P27361 细节
磷脂酰丝氨酸合酶1 P48651 细节
Microtubule-associated蛋白2 P11137 细节
CD44抗原 P16070 细节
热休克蛋白hsp90 - α P07900 细节
蛋白激酶C型 P17252 细节
Microtubule-associated蛋白1 P78559 细节
14-3-3蛋白ζ/δ P63104 细节
Phosphatidylethanolamine-binding蛋白1 P30086 细节
纤连蛋白 P02751 细节
多药耐药相关蛋白4 O15439 细节
脱氧尿苷5'-三磷酸核苷酸水解酶，线粒体 P33316 细节
camp特异性3'，5'-环磷酸二酯酶4D Q08499 细节
微管蛋白alpha-1C链 Q9BQE3 细节
Fructose-bisphosphate醛缩酶一 P04075 细节
Ras-related蛋白质Rab-9A P51151 细节
双特异性蛋白激酶CLK1 P49759 细节
热休克蛋白hsp90 - β P08238 细节
角蛋白，II型细胞骨架 P05787 细节
Synaptotagmin-like蛋白4 Q96C24 细节
依赖吡哆醛的脱羧酶结构域蛋白1 Q6P996 细节
磷脂酶D1 Q13393 细节
Peptidyl-glycine alpha-amidating单氧酶 P19021 细节
CAD蛋白质 P27708 细节
Phosphoribosylformylglycinamidine合酶 O15067 细节
磷脂酰丝氨酸合酶2 Q9BVG9 细节
肽酰脯氨酰顺反异构酶G Q13427 细节
组蛋白脱乙酰酶1 Q13547 细节
组蛋白脱乙酰酶2 Q92769 细节
组蛋白脱乙酰酶3 O15379 细节
蛋白质法尼基转移酶亚基β P49356 细节
dna依赖性蛋白激酶催化亚基 P78527 细节
DNA拓扑异构酶2β Q02880 细节
角蛋白，II型细胞骨架 P08729 细节
电压依赖性阴离子选择通道蛋白1 P21796 细节
电压依赖性阴离子选择通道蛋白2 P45880 细节
氨基端kinase-like蛋白质 Q96KG9 细节
前列腺素E合成酶3 Q15185 细节
局部粘附激酶1 Q05397 细节
远上游元素结合蛋白1 Q96AE4 细节
camp依赖性蛋白激酶ii - α调节亚基 P13861 细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基 P10644 细节
热休克蛋白-1 P04792 细节
炭疽毒素受体1 Q9H6X2 细节
Ribosome-binding蛋白1 Q9P2E9 细节
Microtubule-associated蛋白4 P27816 细节
肌浆/内质网钙atp酶2 P16615 细节
热休克因子蛋白1 Q00613 细节
整合素alpha-V P06756 细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体 P11717 细节
可能是低亲和力铜吸收蛋白2 O15432 细节
分解素和金属蛋白酶结构域蛋白17 P78536 细节
Uracil-DNA糖基化酶 P13051 细节
Endothelin-converting酶1 P42892 细节
内心的着丝粒蛋白 Q9NQS7 细节
60S核糖体蛋白L23a P62750 细节
Triosephosphate异构酶 P60174 细节
细胞色素b-c1复合体亚基6，线粒体 P07919 细节
蛋白酶体亚基阿尔法-3型 P25788 细节
蛋白酶体亚基α -5型 P28066 细节
酪蛋白激酶I亚型-3 Q9Y6M4 细节
双特异性蛋白激酶CLK3 P49761 细节
核受体辅激活剂 Q9HCD5 细节
细胞周期蛋白依赖性激酶16 Q00536 细节
过氧化物酶体酰辅酶A氧化酶1 Q15067 细节
MKL / myocardin-like蛋白1 Q969V6 细节
Destrin P60981 细节
Cofilin-1 P23528 细节
肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基1B O15143 细节
延长因子2 P13639 细节
RNA聚合酶II转录亚基1的介质 Q15648 细节
Epsin-1 Q9Y6I3 细节
磷酸甘油酸酯激酶1 P00558 细节
Phosphoglucomutase-1 P36871 细节
波形蛋白 P08670 细节
肌醇1,4,5-三磷酸受体1型 Q14643 细节
[3-甲基-2-氧丁酸脱氢酶[脂酰胺]]激酶，线粒体 O14874 细节
排序nexin-3 O60493 细节
染色质亚家族A成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调控因子5 O60264 细节
Spectrin β链，非红细胞1 Q01082 细节
碳酸氢钠共转运蛋白 Q9Y6M7 细节
Myc原癌基因蛋白 P01106 细节
断点簇区域蛋白质 P11274 细节
双特异性丝裂原活化蛋白激酶2 P36507 细节
丝裂原活化蛋白激酶激酶2 Q9Y2U5 细节
RalA-binding蛋白1 Q15311 细节
膜相关孕酮受体成分1 O00264 细节
组蛋白H1.4 P10412 细节
酪蛋白激酶II亚基β P67870 细节
PML蛋白 P29590 细节
核仁和盘体磷酸蛋白1 Q14978 细节
拉到 P46939 细节
原蛋白转化酶枯草菌素/可欣型9 Q8NBP7 细节
异质核核糖核蛋白H P31943 细节
异质核核糖核蛋白H3 P31942 细节
Hepatoma-derived生长因子 P51858 细节
cap特异性mRNA(核苷-2'- o -)甲基转移酶1 Q8N1G2 细节
神经细胞粘附分子L1 P32004 细节
异质核核糖核蛋白K P61978 细节
热休克蛋白105 kDa Q92598 细节
核迁移蛋白nnc Q9Y266 细节
肿瘤蛋白质D54 O43399 细节
14-3-3蛋白θ P27348 细节
染色体盒蛋白同源物5 P45973 细节
结plakoglobin P14923 细节
远上游元素结合蛋白2 Q92945 细节
富含半胱氨酸和甘氨酸的蛋白质 P21291 细节
Filamin-A P21333 细节
异质核核糖核蛋白D0 Q14103 细节
异染色质蛋白1-结合蛋白3 Q5SSJ5 细节
Ras gtpase激活样蛋白IQGAP1 P46940 细节
Nucleophosmin P06748 细节
60S核糖体蛋白L14 P50914 细节
40S核糖体蛋白S6 P62753 细节
剪接因子1 Q15637 细节
丝氨酸/精氨酸富剪接因子4 Q08170 细节
Zyxin Q15942 细节
富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子 Q07955 细节
生存运动神经元蛋白 B4DP61 细节
Myosin-9 P35579 细节
剪接因子3B亚基1 O75533 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶24 Q9Y6E0 细节
非受体酪氨酸蛋白激酶TNK1 Q13470 细节
ap2相关蛋白激酶1 Q2M2I8 细节
BMP-2-inducible蛋白激酶 Q9NSY1 细节
双特异性蛋白激酶CLK4 Q9HAZ1 细节
eIF-2-alpha激酶GCN2 Q9P2K8 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶MARK2 Q7KZI7 细节
母体胚胎亮氨酸拉链激酶 Q14680 细节
Misshapen-like激酶1 Q8N4C8 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶OSR1 O95747 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 2 Q13177 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PAK 4 O96013 细节
磷脂酰肌醇4-kinaseβ Q9UBF8 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2 Q16513 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶PRP4同源物 Q13523 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO2 Q9BVS4 细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 Q15910 细节
依赖nadd的蛋白去乙酰化酶sirtuin-2 Q8IXJ6 细节
肌营养不良蛋白 P11532 细节
细胞色素b还原酶1 Q53TN4 细节
atp柠檬酸合酶 P53396 细节
钠偶联中性氨基酸转运蛋白1 Q9H2H9 细节
DNA甲基转移酶3 (cytosine-5) Q9Y6K1 细节
锌转运体1 Q9Y6M5 细节
质膜钙转运atp酶1 P20020 细节
白细胞介素-6受体亚单位β P40189 细节
受体酪氨酸蛋白激酶 Q504U8 细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1 Q13541 细节
赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶1A O60341 细节
增殖标志蛋白Ki-67 P46013 细节
ELAV-like蛋白1 Q15717 细节