一套更新的类固醇基准及其在性激素结合球蛋白新纳米摩尔配体发现中的应用。

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Cherkasov A, Ban F, Santos-Filho O, Thorsteinson N, Fallahi M, Hammond GL

一套更新的类固醇基准及其在性激素结合球蛋白新纳米摩尔配体发现中的应用。

医学化学杂志2008年4月10日;51(7):2047-56。doi: 10.1021 / jm7011485。Epub 2008年3月11日

PubMed ID

18330978 (在PubMed

］

摘要

已知激素结合球蛋白(SHBG)亲和力的类固醇的基准数据集已被广泛用于验证流行的基于分子场的QSAR技术。我们通过添加一些从文献和我们之前的实验研究中识别的非甾体SHBG配体扩展了数据集。这一更新的分子集已被用于建立基于“归纳”描述符的4D QSAR模型，并深入了解蛋白质-配体相互作用的分子基础。通过将活性化合物对接到SHBG的活性位点上，生成分子对齐。令人惊讶的是，基准类固醇的对齐与之前CoMFA和CoMSIA模型中使用的经典配体对齐相矛盾，但提供了更高的统计显著性和预测能力。由此产生的QSAR模型结合CoMFA和CoMSiA模型以及基于结构的虚拟筛选，可以发现几种低微摩尔到纳摩尔的人类SHBG非甾体抑制剂。

引用本文的药库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
2-Methoxyestradiol	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.832	N/A	N/A	细节
达那唑	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	6.3	N/A	N/A	细节
雌二醇	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	1．5	N/A	N/A	细节
雌三醇	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	234	N/A	N/A	细节
雌激素酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	6.6	N/A	N/A	细节
染料木黄酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	39811	N/A	N/A	细节
氢化可的松	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	631	N/A	N/A	细节
Levonorgestrel	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	1．2	N/A	N/A	细节
Methyltestosterone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	3．7	N/A	N/A	细节
柚苷配基	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	955	N/A	N/A	细节
柚苷配基	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	28184	N/A	N/A	细节
Norethisterone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	11	N/A	N/A	细节
孕酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	115	N/A	N/A	细节
Stanolone	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.182	N/A	N/A	细节
睾酮	性hormone-binding球蛋白	Kd (nM)	0.631	N/A	N/A	细节