提高二氧化钛富集此处则从海拉细胞和高自信此处则识别交叉验证的MS / MS和MS / MS / MS谱。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

陈朱昱LR, Z, KC, Issaq HJ,季米特洛夫DS, Veenstra道明

提高二氧化钛富集此处则从海拉细胞和高自信此处则识别交叉验证的MS / MS和MS / MS / MS谱。

J蛋白质组研究》2007年11月,6 (11):4150 - 62。Epub 2007 10月9。

PubMed ID

17924679 (在PubMed

]

文摘

因为磷酸化蛋白质分析法浓缩是必不可少的组织磷酸化蛋白质组通常出现在细胞丰度较低。最近,二氧化钛(TiO2)已被证实能丰富此处则从简单和高特异性肽混合物;然而,这项技术还没有优化。在目前的研究中,重要的非特异性绑定时观察到蛋白质组样本用于二氧化钛列。列用NH4Glu解决方案后加载肽混合物的效率显著提高二氧化钛此处则浓缩回收率高达84%。蛋白质组样品,超过2倍增加独特的此处则识别已经实现。使用的NH4Glu二氧化钛柱洗不显著降低此处则复苏。共有858名此处则对应于1034种不同phosphosites已经从海拉细胞被确认使用改进后的二氧化钛富集过程结合视中性nano-RPLC-MS2-MS3损失分析。而41和35%的此处则是确定只有一份和MS3,分别被确认一份和MS3 24%。交叉验证的此处则分配一份和MS3扫描导致身份最高的信心(99.5%)。 Many phosphosites identified in this study appear to be novel, including sites from antigen Ki-67, nucleolar phosphoprotein p130, and Treacle protein. The study also indicates that evaluation of confidence levels for phosphopeptide identification via the reversed sequence database searching strategy might underestimate the false positive rate.

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
视黄段蛋白3	Q8NFJ5	细节
DNA拓扑异构酶2α	P11388	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基平方米	P31350	细节
热休克蛋白beta 1	P04792	细节
Ribosome-binding蛋白1	Q9P2E9	细节
Microtubule-associated蛋白4	P27816	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
Triosephosphate异构酶	P60174	细节
Phosphoglucomutase-1	P36871	细节
波形蛋白	P08670	细节
血影蛋白β链,non-erythrocytic 1	Q01082	细节
膜相关组件1孕激素受体	O00264	细节
核仁的和coiled-body磷蛋白质1	Q14978	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
Filamin-A	P21333	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60年代L14核糖体蛋白质	P50914	细节
Zyxin	Q15942	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
atp柠檬酸合酶	P53396	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
ELAV-like蛋白1	Q15717	细节