日本人群CYP2C19的遗传变异和单倍型。

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福岛上坂H，斋藤Y，前川K，小泽S，长谷川R，梶雄H，久谷N，安田K，川本M, Kamatani N，铃木K，柳川T, Tohkin M，泽田J

日本人群CYP2C19的遗传变异和单倍型。

《mettab Pharmacokinet》2005 Aug;20(4):300-7。

PubMed ID
16141610 (PubMed视图
］
摘要

在253名日本受试者(134名糖尿病患者和119名健康志愿者)的CYP2C19的5’-调控区、所有外显子及其周围内含子中发现了48个单核苷酸变异，其中包括27个新变异。经鉴定的新变异位点为:增强子区-2772G>A、2767_2760delggtgaaca、-2720T>C、-2547delG、-2545G>T、- 2545_2544 delGC和-2040C>T;启动子区-778C>T， -777G>A， -529G>C， -189C>A， -185A>G;外显子中的151A>G (S51G)、481G>C (A161P)、986G>A (R329H)、1078G>A (D360N)和1119C>T (D373D)，内含子中的IVS1+128T>A、IVS3+163G>A、IVS4+271A>G、IVS5-49A>G、IVS6-210C>T、IVS6-196T>A、IVS6-32T>A、IVS7+84G>A、IVS7- 174c >T和IVS8+64C>T。由于我们发现健康志愿者与糖尿病患者之间的变异频率没有显著差异，因此将所有受试者的数据作为一组进行进一步分析。IVS6-196T>A等位基因频率为0.265，-2772 2g >A和-2720T>C等位基因频率为0.045，-2040C>T等位基因频率为0.024,IVS7-174C>T等位基因频率为0.010，-529G>C等位基因频率为0.006,IVS1+128T>A和481G>C (A161P)等位基因频率为0.004，- 2767_2760delggtgaaca和IVS6-210C>T等位基因频率为0.002。此外，已知的两个非同义单核苷酸多态性，681G>A(剪接缺陷，(*)2等位基因)和636G>A (W212X;(*)3个等位基因)的检测频率分别为0.267和0.128。本构雄甾烷受体和糖皮质激素受体的已知结合位点未检测到变化。连锁不平衡分析显示，在整个基因中存在几个密切的变异联系。 By using the variations, thirty-one haplotypes of CYP2C19 and their frequencies were estimated. Our results would provide fundamental and useful information for genotyping CYP2C19 in the Japanese and probably other Asian populations.

引用本文的药物库数据

多肽
名字 UniProt ID
细胞色素P450 2C19 P33261 细节
Pharmaco-genomics
药物 相互作用的基因/酶 等位基因的名字 基因型 定义变化(s) 类型(年代) 描述 细节
阿米替林 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 美国存托凭证推断出 AA或AG基因型阿米替林代谢不良 细节
阿米替林 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 3 不可用 美国存托凭证推断出 AA或AG基因型阿米替林代谢不良 细节
奥美拉唑 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 代谢产物差，剂量要求低，药效提高 细节
Clobazam 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 美国存托凭证推断出 Clobazem主要通过CYP3A4代谢成n -去甲基Clobazem (NCLB)。NCLB主要由2C19代谢。2C19*2等位基因1*/2*突变者为NCLB中间代谢产物。与广泛的代谢物(1*/1*)相比，具有两个(2*/2*)突变的人对NCLB的代谢较差。与广泛代谢者相比，低代谢者的NCLB水平可能高出5倍，中等代谢者的NCLB水平高出2倍。CYP2C19*2基因多态性表达可能影响氯巴坦的安全性和疗效。 细节
Clobazam 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 3 不可用 美国存托凭证推断出 Clobazem主要通过CYP3A4代谢成n -去甲基Clobazem (NCLB)。NCLB主要由2C19代谢。2C19*2等位基因1*/2*突变者为NCLB中间代谢产物。与广泛的代谢物(1*/1*)相比，具有两个(2*/2*)突变的人对NCLB的代谢较差。与广泛代谢者相比，低代谢者的NCLB水平可能高出5倍，中等代谢者的NCLB水平高出2倍。CYP2C19*2基因多态性表达可能影响氯巴坦的安全性和疗效。 细节
Lansoprazole 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 代谢产物差，剂量要求低，药效提高 细节
美芬妥因 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 代谢产物差，剂量要求低 细节
拉唑 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 代谢产物差，剂量要求低，药效提高 细节
氯吡格雷 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 药物代谢不良，剂量要求低，药物-药物相互作用风险高 细节
氯吡格雷 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 3 不可用 效果推断出 药物代谢不良，剂量要求低，药物-药物相互作用风险高 细节
氯胍 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 代谢产物差，剂量要求低 细节
格列齐特 细胞色素P450 2C19
基因符号:CYP2C19
UniProt:P33261		 CYP2C19 * 2 不可用 效果推断出 药物代谢不良。 细节