二十碳五烯结构和亚油酸的环氧酶的前列腺素内过氧化物H synthase-1。

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Malkowski毫克,Thuresson ED, Lakkides公里,雷基CJ, Micielli R,史密斯王,无人RM

二十碳五烯结构和亚油酸的环氧酶的前列腺素内过氧化物H synthase-1。

生物化学杂志。2001年10月5日;276 (40):37547 - 55。Epub 2001年7月27日。

PubMed ID
11477109 (在PubMed
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文摘

前列腺素内过氧化物H synthases-1和2 (PGHSs)可以氧化碳多不饱和脂肪酸在18到22岁,虽然不同的效率。在这里,我们报告的晶体结构二十碳五烯酸(EPA,二十5 n - 3)和亚油酸(洛杉矶,18:2 n-6)绑定的环氧酶活性部位的Co(3 +)原卟啉IX-reconstituted绵羊的PGHS-1 (Co (3 +) -oPGHS-1)和比较活跃的影响站点替换EPA的氧化率,洛杉矶,和花生四烯酸(AA)。EPA和LA绑定在活动网站方向类似前面所看到的那样,AA和dihomo-gamma-linolenic酸(DHLA)。EPA,额外的双键的存在(c - 17 / C-18)导致基质结合的“紧张”构象c13是偏差对酪氨酸- 385,从底物脂肪酸提取氢的残渣。据推测,该偏差负责环保局氧化的低利率。洛杉矶的羧基结合在一个扩展的配置超过一半AA,导致定位C-11旁边酪氨酸- 385。最近val - 349和ser - 530,确认为重要因素有效的氧化DHLA PGHS-1,扮演类似的角色在EPA和洛杉矶的氧化。大约750 - 175倍减少EPA和洛杉矶的氧化效率观察与V349A oPGHS-1,而2倍改变为AA。val - 349 c - 2接触和颈的EPA和c - 4 LA定向这些基质的羧基部分氢抽象的正常omega-ends是一致的。S530T替代降低了V (max) / K (m) EPA和洛杉矶的375 - 140倍。 Ser-530 makes six contacts with EPA and four with LA involving C-8 through C-16; these interactions influence the alignment of the substrate for hydrogen abstraction. Interestingly, replacement of Phe-205 increases the volume of the cyclooxygenase site allowing EPA to be oxygenated more efficiently than with native oPGHS-1.

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点
药物 目标 生物 药理作用 行动
Dihomo-gamma-linolenic酸 前列腺素合成酶1 G / H 蛋白质 人类
是的
抑制剂
细节
Icosapent 前列腺素合成酶1 G / H 蛋白质 人类
是的
抑制剂
细节