用连续IMAC和氧化钛富集法分析原代人T淋巴细胞磷酸化。

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卡拉斯卡尔，奥韦雷罗D，卡萨斯V，盖伊M，阿比安J

用连续IMAC和氧化钛富集法分析原代人T淋巴细胞磷酸化。

蛋白质组学杂志，2008年12月;7(12):5167-76。

PubMed ID

19367720 (PubMed视图

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摘要

T淋巴细胞介导细胞和体液对异物或自身抗原的防御。对t细胞信息处理的理解进一步促进了免疫反应的研究。我们描述了使用多维分离策略对原代T细胞进行大规模磷酸化分析，包括制备SDS-PAGE进行预分离，凝胶内消化和使用IMAC和TiO2连续富集磷酸肽。在LTQ线性离子阱中，通过LC-MS(n)分析，共鉴定出281个磷酸化位点(197个高置信度，Ascore > 15)，对应204个人类基因序列。随后，我们创建了淋巴系统数据库(http://lymphos.org)，它将质谱肽信息与磷酸化位点和磷酸化蛋白序列联系起来。

引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
b淋巴细胞抗原CD20	P11836	细节
CD44抗原	P16070	细节
热休克蛋白hsp90 - α	P07900	细节
微管蛋白-3链	Q13509	细节
DNA拓扑异构酶2- β	Q02880	细节
前列腺素E合成酶3	Q15185	细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基	P10644	细节
不依赖阳离子的甘露糖-6-磷酸受体	P11717	细节
Triosephosphate异构酶	P60174	细节
蛋白酶体亚单位α -3型	P25788	细节
Epsin-1	Q9Y6I3	细节
膜相关孕酮受体成分1	O00264	细节
肝癌源性生长因子	P51858	细节
蛋白质S100-A9	P06702	细节
肿瘤蛋白D54	O43399	细节
泛素羧基末端水解酶14	P54578	细节
Filamin-A	P21333	细节
异质核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
异染色质蛋白1结合蛋白3	Q5SSJ5	细节
Myosin-9	P35579	细节
ap2相关蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶10	O94804	细节