ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。

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Matsuoka S, Ballif BA, Smogorzewska A, McDonald ER 3rd, Hurov KE, Luo J, Bakalarski CE, Zhao Z, Solimini N, Lerenthal Y, Shiloh Y, Gygi SP, Elledge SJ

ATM和ATR底物分析揭示了广泛的蛋白质网络对DNA损伤的响应。

科学，2007年5月25日;316(5828):1160-6。

PubMed ID

17525332 (PubMed视图

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摘要

细胞对DNA损伤的反应是由一些蛋白激酶介导的，包括ATM(共济失调毛细血管扩张突变)和ATR (ATM和rad3相关)。该途径的信号转导部分的轮廓是已知的，但对DNA损伤反应(DDR)的生理范围知之甚少。我们对ATM和ATR识别的一致位点上响应DNA损伤磷酸化的蛋白质进行了大规模的蛋白质组学分析，并确定了900多个调控磷酸化位点，包括700多个蛋白质。对该数据集子集的功能分析表明，该列表中涉及DDR的蛋白质高度富集。这组蛋白质是高度互联的，我们发现了大量的蛋白质模块和网络，之前没有连接到DDR。该数据库为DDR描绘了比以前更广阔的图景，并为研究哺乳动物对DNA损伤的反应开辟了新的途径。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
RAF原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	P04049	细节
丝氨酸-tRNA连接酶，细胞质	P49591	细节
Abelson酪氨酸蛋白激酶2	P42684	细节
-2肾上腺素能受体	P07550	细节
钠/氢交换器	P19634	细节
环amp响应元件结合蛋白1	P16220	细节
丝裂原活化蛋白激酶14	Q16539	细节
Deoxyhypusine合酶	P49366	细节
微管相关蛋白1A	P78559	细节
聚[adp -核糖]聚合酶	P09874	细节
激酶样蛋白KIF11	P52732	细节
热休克蛋白hsp90 - β	P08238	细节
肽酰脯氨酸顺反异构酶G	Q13427	细节
dna依赖性蛋白激酶催化亚基	P78527	细节
DNA拓扑异构酶2- β	Q02880	细节
可能依赖于atp的RNA解旋酶DDX6	P26196	细节
c末端结合蛋白1	Q13363	细节
脱氧胞苷激酶	P27707	细节
细胞肿瘤抗原p53	P04637	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶	O14757	细节
b淋巴细胞抗原CD19	P15391	细节
DNA聚合酶催化亚基A	Q07864	细节
DNA聚合酶4亚基	Q9NR33	细节
核受体共激活因子1	Q15788	细节
肽基脯氨酸顺反异构酶	Q13526	细节
热休克同源蛋白71 kDa	P11142	细节
CREB-binding蛋白质	Q92793	细节
RNA聚合酶II转录亚基1的中介物	Q15648	细节
过渡内质网atp酶	P55072	细节
驱动蛋白样蛋白KIF2C	Q99661	细节
丝氨酸蛋白激酶ATM	Q13315	细节
异质核核糖核蛋白F	P52597	细节
热休克70 kDa蛋白4	P34932	细节
远上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
异染色质蛋白1结合蛋白3	Q5SSJ5	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LATS1	O95835	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1	O95747	细节
v型质子atp酶116 kDa亚基a亚型2	Q9Y487	细节
真核翻译起始因子4e结合蛋白1	Q13541	细节