细胞色素P450 2D6模型的验证:预测代谢和抑制的硅内工具。

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Kemp CA, Flanagan JU, van Eldik AJ, Marechal JD, Wolf CR, Roberts GC, Paine MJ, Sutcliffe MJ

细胞色素P450 2D6模型的验证:预测代谢和抑制的硅内工具。

中华医学化学杂志2004 10月21日;47(22):5340-6。

PubMed ID

15481972 (PubMed视图

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摘要

人们对细胞色素P450 2D6预测模型的开发非常感兴趣，特别是因为这种酶参与了至少50种药物的氧化。之前我们已经描述了同源建模和分子对接的联合使用，以正确定位一系列底物在CYP2D6活性位点与血红素以上的已知代谢位点。在这里，我们的方法正确地识别了非典型(无碱性氮)细胞色素P450 2D6底物螺磺胺的代谢部位。同样的方法用于筛选细胞色素P450 2D6抑制的小型化合物数据库。使用程序GOLDv2.0将来自国家癌症研究所数据库中包含33种化合物的数据库停靠到我们的细胞色素P450 2D6同源模型中。测定了33种化合物的IC50值;与相应的对接评分比较，回归系数r2 = 0.61 (q2 = 0.59)。该方法能够区分紧密和弱结合化合物，并正确识别出几种新的抑制剂。因此，结果表明，我们将同源建模与分子对接相结合的方法，已经为细胞色素P450 2D6抑制产生了有用的硅基预测工具，该工具最好用作多过滤器数据库屏幕中的一个过滤器。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
去甲替林	细胞色素P450 2D6	IC 50 (nM)	2600	N/A	N/A	细节
奎尼丁	细胞色素P450 2D6	IC 50 (nM)	10	N/A	N/A	细节
奎尼丁	细胞色素P450 2D6	Ki (nM)	30.	N/A	N/A	细节
育亨宾	细胞色素P450 2D6	Ki (nM)	180	N/A	N/A	细节
育亨宾	细胞色素P450 2D6	IC 50 (nM)	8.4	N/A	N/A	细节