氨基糖苷类核糖体相互作用揭示小说构象州在环境温度。
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氨基糖苷类核糖体相互作用揭示小说构象州在环境温度。
核酸研究》2018年10月12日,46 (18):9793 - 9804。doi: 10.1093 / nar / gky693。
- PubMed ID
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30113694 (在PubMed]
- 文摘
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30年代细菌核糖体亚基是一种主要的抗生素的目标。尽管几十年的发现,抗生素绑定诱发核糖体功能障碍的机制尚未完全了解。环境温度晶体技术允许更多的生物相关调查当地的抗生素结合位点的相互作用引发全球单元重组,扰乱蛋白质合成。这里,2-deoxystreptamine的结构效应(巴龙霉素和西索米星),小说西索米星导数,N1-methyl磺酰西索米星(N1MS)和non-deoxystreptamine(链霉素)氨基糖甙类在核糖体上环境和低温下检查。比较研究了三个主要的观察。第一,个人aminoglycoside-ribosome解码中心交互为低温与环境温度结构相似。第二,分析一个高度保守的GGAA tetraloop h45透露aminoglycoside-specific构象变化,这对N1MS只受温度影响。我们报告h44-h45界面在不同的州,例如,闲散和平衡。第三,我们观察aminoglycoside-induced对30年代的影响域关闭,包括小说中介关闭状态,这也是对温度敏感。分析三种环境和五个低温晶体学数据集显示关闭h44-h45订婚和域之间的相关性。 These observations illustrate the role of ambient temperature crystallography in identifying dynamic mechanisms of ribosomal dysfunction induced by local drug-binding site interactions. Together, these data identify tertiary ribosomal structural changes induced by aminoglycoside binding that provides functional insight and targets for drug design.