dihydropyridine绑定到l型钙通道的结构模型。

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Tikhonov DB, Zhorov BS

dihydropyridine绑定到l型钙通道的结构模型。

J生物化学杂志。2009年7月10日,284(28):19006 - 17所示。doi: 10.1074 / jbc.M109.011296。2009年5月5日Epub。

PubMed ID
19416978 (在PubMed
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文摘

1,4-Dihydropyridines(井下供电)构成一个主要类的配体l型钙通道(2 +)高瓦斯)。井下供电有boat-like,六元环NH集团在船尾,取代基的芳基鞠躬,在港口和右舷。各种井下供电展览敌对或竞赛的活动,以前解释为稳定或不稳定,分别激活关闭大门的左边的取代基。这里我们报告一个小说结构模型受体激动剂和拮抗剂活动是由不同部分的设计马力分子和有不同的机制。在我们的模型中,基于蒙特卡罗DHP-LTCC复合物的最小化设计马力根在船尾,弓,和右舷H-bonds侧链的关键DHP-sensing残留Tyr_IIIS6 Tyr_IVS6和Gln_IIIS5分别。我们建议这些H-bonds,常见的受体激动剂和拮抗剂,稳定开放激活的确立构象门。这就解释了为什么受体激动剂和拮抗剂的概率增加持久通道开口,为什么即使接触的部分干扰消除了论争的行动。在我们的模型中,左边的方法的选择性过滤器。疏水性的左舷拮抗剂可能产生持久的通道关闭由不稳定的Ca(2 +)绑定到选择性过滤谷氨酸。受体激动剂有取代基亲水性或左边的一个氢原子,从而缺乏这种不稳定的影响。 The predicted orientation of the DHP core allows accommodation of long substituents in the domain interface or in the inner pore. Our model may be useful for developing novel clinically relevant LTCC blockers.

DrugBank数据引用了这篇文章

药物
药物靶点
药物 目标 生物 药理作用 行动
Barnidipine 压敏电阻器l型钙通道亚基alpha-1C 蛋白质 人类
是的
拮抗剂
细节
Pinaverium 压敏电阻器l型钙通道亚基alpha - 蛋白质 人类
是的
拮抗剂
抑制剂
细节