人血清白蛋白结合布洛芬:尿素中展开途径的3D描述。
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Galantini L, Leggio C, Konarev PV, Pavel NV
人血清白蛋白结合布洛芬:尿素中展开途径的3D描述。
生物化学学报，2010年4月;47(3):344 - 344。doi: 10.1016 / j.bpc.2010.01.002。Epub 2010 1月18日。
- PubMed ID
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20117876 (PubMed视图］
- 摘要
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在光散射测量和光谱数据(圆二色和荧光)的支持下，小角度x射线散射(SAXS)技术使我们能够在低分辨率下恢复脱脂人血清白蛋白(HSA)与布洛芬相互作用的3D结构。数据是在一组尿素浓度为0.00 - 9.00M的HSA溶液中进行的。应用于完整SAXS数据集的奇异值分解方法使我们能够区分溶液中的三种不同状态。特别是一种原生构象N (0.00M尿素)，一种中间构象I1 (6.05M尿素)和一种未展开结构U (9.00M尿素)被识别出来。采用从头拟合和刚体拟合的方法得到了这些状态的低分辨率结构。特别是，对于没有变性剂的蛋白质，最近描述的一种构象(Leggio等人，PCCP, 2008,10,6741 -6750)被证实非常类似于晶体学上的心形，只有三个结构域的轻微相互移动。I1结构仅具有封闭结构域(结构域III)的特征，最终，恢复的U态结构显示出完全开放状态的特征。与游离HSA的直接比较指出，布洛芬的存在引起平衡向更高尿素浓度的转移，而不改变展开顺序。这项工作代表了一种类型的分析，可以用于未来对溶液中的蛋白质、药物或内源性化合物的结合、药代动力学性质以及变构效应、合作或反合作机制的研究。