建模和生物信息学的研究人类Kappa-class谷胱甘肽转移酶预测小说第三谷胱甘肽转移酶家族相似性原核2-hydroxychromene-2-carboxylate异构酶。

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罗宾逊,Huttley GA、展位HS PG

建模和生物信息学的研究人类Kappa-class谷胱甘肽转移酶预测小说第三谷胱甘肽转移酶家族相似性原核2-hydroxychromene-2-carboxylate异构酶。

j . 2004 5月1日,379 (Pt 3): 541 - 52。

PubMed ID

14709161 (在PubMed

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文摘

消费税(谷胱甘肽转移酶)的Kappa类包括可溶性酶原来孤立于线粒体基质的老鼠。我们已经从人类乳房Kappa类cDNA特征。单个基因的cDNA来源于由八个外显子和7个内含子位于染色体7 q34-35。为重组hGSTK1-1表达在大肠杆菌(亚基分子量大约25.5 kDa)。重大glutathione-conjugating活动被发现只有模型基质CDNB (1-chloro-2 4-ditnitrobenzene)。双曲动力学得到的谷胱甘肽(参数:K (m)应用程序,3.3 + / - -0.95毫米;V (max)应用程序,21.4 + / - -1.8 micromol每毫克的酶/分钟),而s形动力学得到CDNB(参数:S0.5app 1.5 + / - -1.0毫米;V (max)应用程序,40.3 + / - -0.3 micromol每毫克的酶/分钟;希尔系数1.3),反映出低底物的亲和力。序列分析、同源性建模和二级结构预测表明,hGSTK1 (a)最相似的细菌HCCA (2-hydroxychromene-2-carboxylate)异构酶和(b)预测C端域结构几乎一模一样的细菌disulphide-bond-forming DsbA氧化还原酶(均方根偏差0.5 - -0.6)。预计hGSTK1和HCCA异构酶的结构拥有一个硫氧还蛋白折叠polyhelical域(α(x))之间的嵌入beta-strands (betaalphabetaalpha (x) betabetaalpha,强调元素代表了N和C硫氧还蛋白折叠的图案),发生在细菌disulphide-bond-forming氧化还原酶。 This is in contrast with the cytosolic GSTs, where the helical domain occurs exclusively at the C-terminus (betaalphabetaalphabetabetaalphaalpha(x)). Although hGSTK1-1 catalyses some typical GST reactions, we propose that it is structurally distinct from other classes of cytosolic GSTs. The present study suggests that the Kappa class may have arisen in prokaryotes well before the divergence of the cytosolic GSTs.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
谷胱甘肽	谷胱甘肽S-transferase kappa 1	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节

多肽

的名字	UniProt ID
谷胱甘肽S-transferase kappa 1	Q9Y2Q3	细节