合成、活动,初步thrombomodulin第四EGF-like域的结构。
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专职阿訇DP,猎人MJ, Komives EA
合成、活动,初步thrombomodulin第四EGF-like域的结构。
蛋白质科学。1995年9月,4 (9):1683 - 95。
- PubMed ID
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8528067 (在PubMed]
- 文摘
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第四EGF-like域thrombomodulin (TM4),残留在TM E346-F389序列,合成。重折叠合成产品的氧化还原条件下给一个主要产品。折叠的二硫键模式,氧化域(1 - 3、2 - 4、5 - 6),这是一样的,发现EGF蛋白。TM4 TM抗凝活性的测试,因为删除和替换诱变实验表明,第四EGF-like域TM对TM代数余子式活动至关重要。TM4没有TM-like活动两个试验系统,对抑制纤维蛋白凝块的形成,和代数余子式活动凝血酶激活蛋白c .初步TM4结构是由2 d 1 h NMR从519年NOE-derived距离约束。距离几何计算了一个收敛的结构。结构类似于表皮生长因子和其他已知的EGF-like域的结构,但一些关键的差异。中央具有β褶板是守恒的,尽管不同的氨基酸在循环的数量。C372之间的二硫键形成的c端环和C386 TM4五氨基酸超过C33之间的类似的循环和促EGF蛋白。这个循环似乎有不同的褶皱在TM4 EGF蛋白。 The loop forms the two outside strands of a broken, irregular tri-stranded beta-sheet, and amino acids H384-F389 lie between the two strands forming the middle strand of the sheet. Thus, although the C-terminus of EGF protein forms one of the outside strands of a tri-stranded antiparallel sheet, the C-terminus of TM4 forms the inside strand of an irregular tri-stranded parallel-anti-parallel sheet. The residues D349, E357, and E374, which were shown to be critical for cofactor activity by alanine scanning mutagenesis, all lie in a patch near the C-terminal loop, and are solvent accessible. The other critical residues, Y358 and F376, are largely buried and appear to play essential structural rather than functional roles.