与HLA-DR1结合的主要天然加工肽来自mhc相关分子,大小不均匀。

文章的细节

引用

Chicz RM, Urban RG, Lane WS, Gorga JC, Stern LJ, Vignali DA, Strominger JL

与HLA-DR1结合的主要天然加工肽来自mhc相关分子,大小不均匀。

自然。1992年8月27日;358(6389):764-8。

PubMed ID
1380674 (PubMed视图
摘要

与I类分子结合的肽长8-10个氨基酸,并具有与给定I类等位基因结合的肽的结合基序。在唯一发表的自然加工肽结合II类分子(小鼠I-Ab和I-Eb)的研究中,这些肽更长(13-17个氨基酸),具有异质羧基末端,但精确的氨基末端截断。在这里,我们报告了酸洗脱肽结合HLA-DR1的表征,通过高效液相色谱,质谱和微测序分析。这些肽的相对分子质量在1602 ~ 2996之间(13 ~ 25个残基),最丰富的个体M(r)值在1700 ~ 1800之间,对应于平均15个残基。获得了来自5个表位的20个多肽的完整序列数据,其中除1个外均来自自身蛋白。这些肽表示嵌套在N端和c端。结合实验证实,分离得到的肽段对DR1的沟槽具有较高的亲和力。与HLA-DR1结合的多肽的比对和35个已知的HLA-DR1结合多肽的序列揭示了一个假定的基序。虽然结合到II类分子的肽可能具有一些相关的特征(由于HLA-DR α链的非多态性),解释了与不同等位基因的简并结合,HLA-DR β链中的特定氨基酸可能定义了肽结合的等位基因特异性。

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
钠钾转运atp酶亚基α -1 P05023 细节
转铁蛋白受体蛋白1 P02786 细节