Gelatin-binding地区人类矩阵metalloproteinase-2: COL-23的解决方案结构、动力学、和功能两个域构造。
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Briknarova K, Gehrmann M, Banyai L, Tordai H, Patthy L, Llinas M
Gelatin-binding地区人类矩阵metalloproteinase-2: COL-23的解决方案结构、动力学、和功能两个域构造。
生物化学杂志。2001年7月20日;276(29):27613 - 21所示。Epub 2001年4月24日。
- PubMed ID
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11320090 (在PubMed]
- 文摘
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人类矩阵metalloproteinase-2 (MMP-2)包含三个纤连蛋白II型的数组(造成)模块假设与明胶(变性胶原蛋白)。这里,我们确认的核磁共振的解决方案结构第三造成重复(COL-3)是类似于第二个造成重复(第二列);描述其配体结合性能;和推导动力学特性和相对定位解决方案的两个域COL-23片段,构建第二列和COL-3串联组成,每个域拥有一个假定的collagen-binding网站。交互的合成类似凝胶octadecapeptide (Pro-Pro-Gly) (6) (PPG6) COL-3比与第二列的要弱。我们发现组成的合成肽段33-42(肽33-42)MMP-2 prodomain与COL-3,尽管拥有较低的亲和力,第二列的方式模仿PPG6绑定。COL-3强烈喜欢肽33-42 PPG6,这表明与prodomain分子内相互作用可以调节绑定pro-MMP-2凝胶基质。在COL-23,两个模块保留其结构独立个性和翻滚。总的来说,NMR数据显示的相对取向COL-23不是固定的模块解决方案,模块不相互作用,而COL-23相当灵活。对面的结合位点的脸,他们的反应,和标准化的亲和力,时间越长配体PPG12几乎相同的个人域名PPG6,因而阻碍合作operativity,尽管他们可能与细胞外基质的多个站点同时进行交互。