人类基底由CID撕裂Peptidome表征,HCD,等紧随其后在硅片以及对抗菌肽的体外分析识别。
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奥赫达Azkargorta M的索里亚J, C,古兹曼F, Acera,伊罗纳,苏亚雷斯T, Elortza F
人类基底由CID撕裂Peptidome表征,HCD,等紧随其后在硅片以及对抗菌肽的体外分析识别。
J蛋白质组研究》2015年6月5日,14 (6):2649 - 58。doi: 10.1021 / acs.jproteome.5b00179。2015年5月20日Epub。
- PubMed ID
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25946035 (在PubMed]
- 文摘
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内源性多肽在生物过程的分析是有价值的目标。眼泪电影含有蛋白质和肽释放的泪腺粘膜细胞,包括抗菌肽参与保护对抗外源性病原体;然而,眼泪的肽含量液体特征仍然不佳。我们分析了天然肽从人类分离基底的眼泪。内源性肽的质谱分析提供了一个数量的缺点,包括大小异质性和nonpredictable分裂模式,等等。因此,CID、要领和HCD撕裂肽的方法被用于描述内容。DMSO的贡献作为添加剂的色谱溶剂也被评估。我们确定了157年,131年和122年使用CID -肽,要领,分别和HCD-based方法。,确定了234种不同的肽,导致最大的数据集的生成内源性肽迄今为止。抗菌活性的预测分析在计算机显示不同的假定的抗菌肽。 Two of the extracellular glycoprotein lacritin peptides were de novo synthesized, and their antimicrobial activity was confirmed in vitro. Our findings demonstrate the benefits of using different fragmentation methods for the analysis of endogenous peptides and provide a useful approach for the discovery of peptides with antimicrobial activity.