通过强阴离子交换色谱富集和分离磷酸肽对人肝组织进行大规模磷蛋白组分析。

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韩刚，叶敏，周宏，姜旭，冯松，姜旭，田锐，万东，邹宏，顾军

通过强阴离子交换色谱富集和分离磷酸肽对人肝组织进行大规模磷蛋白组分析。

蛋白质组学，2008年4月;8(7):1346-61。doi: 10.1002 / pmic.200700884。

PubMed ID

18318008 (PubMed视图

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摘要

从蛋白质组样品中富集的磷酸肽混合物是非常复杂的。为了降低复杂性，有必要对磷酸肽进行分馏。然而，传统的富集方法通常只富集磷酸肽，而不分离磷酸肽。在本研究中，介绍了强阴离子交换(SAX)色谱在磷酸肽富集和分离中的应用。结果发现，SAX使磷酸肽高度富集，大多数未修饰的肽不与SAX结合。与Fe(3+)固定金属亲和层析(Fe(3+)-IMAC)相比，SAX仅产生一个部分时，从同一样品中鉴定出几乎两倍的磷酸肽。SAX和Fe(3+)-IMAC在磷酸肽的富集和鉴定方面具有互补性。同时也证明了SAX在梯度洗脱下对磷酸肽的分离能力，这是基于它们与SAX吸附剂的不同相互作用。进一步应用SAX富集和分馏肿瘤区附近人肝组织蛋白质的胰蛋白酶消化中的磷酸肽，用于磷蛋白组分析。这导致从305个独特的磷酸化肽中高度自信地识别出了274个磷酸化位点，对应于168个蛋白质，错误发现率(FDR)为0.96%。

引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
铁蛋白重链	P02794	细节
血清白蛋白	P02768	细节
Ryanodine受体1	P21817	细节
5'- amp激活蛋白激酶亚基β -2	O43741	细节
Thiopurine S-methyltransferase	P51580	细节
Calnexin	P27824	细节
热休克蛋白hsp90 - α	P07900	细节
纤连蛋白	P02751	细节
热休克蛋白hsp90 - β	P08238	细节
组蛋白去乙酰化酶	Q13547	细节
前列腺素E合成酶3	Q15185	细节
camp依赖性蛋白激酶ii型α调节亚基	P13861	细节
camp依赖性蛋白激酶i型α调节亚基	P10644	细节
不依赖阳离子的甘露糖-6-磷酸受体	P11717	细节
蛋白酶体亚单位α -3型	P25788	细节
钙/钙调素依赖性蛋白激酶II型亚单位delta	Q13557	细节
Myosin-11	P35749	细节
camp依赖性蛋白激酶ii型β调节亚基	P31323	细节
14-3-3蛋白质	P62258	细节
膜相关孕酮受体成分1	O00264	细节
核仁和盘状体磷蛋白1	Q14978	细节
肝癌源性生长因子	P51858	细节
蛋白质S100-A9	P06702	细节
Alpha-2-HS-glycoprotein	P02765	细节
异质核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
Myosin-9	P35579	细节
肌球蛋白轻链激酶，平滑肌	Q15746	细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶OSR1	O95747	细节