SEC31L1融合和筛选基因在肿瘤炎症染色法。
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和我,尼尔森T, Domanski哈,法甲M, Lindblom P,莫顿F, Mandahl N
SEC31L1融合和筛选基因在肿瘤炎症染色法。
Int J癌症。2006年3月1;118 (5):1181 - 6。
- PubMed ID
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16161041 (在PubMed]
- 文摘
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炎症肿瘤染色法(IMT)是一个肿瘤染色法组成的梭形细胞和炎性细胞浸润。细胞遗传学分析表明,IMT的子群,特别是儿童和年轻人,港口克隆染色体重组涉及染色体带2 p23。进一步,分子遗传学的研究表明,这些重组目标筛选基因,作为融合基因的3 '伙伴与各种易位的合作伙伴。在目前的研究中,我们描述了小说的发现SEC31L1 /筛选融合基因在一个年轻人的腹部IMT。G-band分析发现易位t (2、4) (p23;温度系数)和随后的荧光原位杂交locus-specific探针强烈表示中断的碱性轨迹染色体上2。疣状与单克隆鼠标反CD246碱性蛋白质显示弥漫性细胞质积极性。使用ALK-gene反向引物,我们可以,5 '运动中方法论,放大一个1.2 kb片段。序列分析表明,nt的片段是一个混合的互补产品3012 SEC31L1 (NM_016211),位于四级温度系数,是融合在坐标系nt 4080碱性(NM_004304)。rt - pcr和两套引物对特定SEC31L1和碱性放大两个记录,在测序与两种类型的嵌合SEC31L1 /筛选记录。在长,类型,记录3012 nt SEC31L1 (NM_016211)熔融碱在坐标系到4080元。 In the short, type II, transcript nt 2670 of SEC31L1 was fused in-frame to nt 4080 of ALK. Genomic PCR and subsequent sequencing showed that the breakpoints were located in intron 23 of SEC31L1 and intron 20 of ALK.