克雷伯氏菌aerogenes脲酶酶蛋白的结构和两个活性位点突变体。
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Jabri E Karplus PA
克雷伯氏菌aerogenes脲酶酶蛋白的结构和两个活性位点突变体。
生物化学。1996年8月20日,35(33):10616 - 26所示。
- PubMed ID
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8718850 (在PubMed]
- 文摘
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脲酶从克雷伯氏菌aerogenes [Jabri et al。(1995) 268年科学,998 - 1004年)是一个(αβγ)3三聚物每个alpha-subunit都有一个(αβ)8-barrel域包含一个binickel活性中心。这里我们更详细地检查结构关系对脲酶通过脲酶酶蛋白的结构分析2.3分辨率和突变体的两个关键的催化残基(H219A和H320A)在2.5一项决议。除了活性部位,水分子的失踪的氨基甲酸酯和镍原子,酶蛋白的结构全酶是几乎相同的,建议高度preorganization这有助于解释镍的紧密结合。H219A结构的主要变化包括构象转变和活性部位皮瓣的排序,但一个小转变Asp的侧链αH219A 221可能导致较低的活动。H320A结构的催化水,主要是Ni-2全酶配体,转变成一个桥接的位置。这种转变表明,镍结扎对环境相当敏感,结扎的变化可能导致10(5)倍降低H320A的活动。此外,这些结果表明,脲酶是弹性镍离子和突变的损失。脲酶三级或四级结构的分析表明,这种酶的稳定性可能主要由于其异常的大部分残留的葬礼:50% gamma-subunit, alpha-subunit beta-subunit的30%和60%。