分析的两种多态形式pyrido [2, 3 - d]嘧啶N9-C10 reversed-bridge antifolate二进制复杂的人类二氢叶酸还原酶。
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科迪V, Galitsky N,勒夫特小,Pangborn W, Gangjee
分析的两种多态形式pyrido [2, 3 - d]嘧啶N9-C10 reversed-bridge antifolate二进制复杂的人类二氢叶酸还原酶。
Acta Crystallogr D Crystallogr杂志。2003年4月,59 (Pt 4): 654 - 61。Epub 2003年3月25日。
- PubMed ID
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12657784 (在PubMed]
- 文摘
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晶体结构测定的结果人类二氢叶酸还原酶(hDHFR)作为二进制与强有力的复杂N9-C10 reversed-bridge antifolate抑制剂2,4-diamino-6 - [N - (3 ', 4 ', 5 ' -trimethoxybenzyl) -N-methylamino] pyrido [2, 3 - d] pyrimidin e(1)是两个独立的报道多态菱形的R3晶格(R3 R3(1)和(2)]。数据从这些两种晶体形式精炼到1.90决议对于复杂的R3 (1), R = 0.186 9689年数据,并决议对于复杂的R3 (2), 1.80 R = 0.194 13 305年的数据。两者之间的循环变化的几何结构接触包装环境的差异反映了两个R3晶格。最大的变化(在0.5和1.7之间)观察循环区域包括第16 - 25残留物,40-48,81 - 89,99 - 108,143 - 148和161 - 169。这些循环的分子间联系的比较表明,R3(2)晶格更紧密,作为反映在规模较小的V (M)值和较小的溶剂含量。抑制剂(1)相似的构象结构和N9-C10桥几何更类似于观察到的正常C9-N10桥trimetrexate (TMQ)比其他N9-C10 reversed-bridge抗之前报道。的影响N9-C10 reversed-bridge几何扭曲桥从共面pyrido [2, 3 - d]嘧啶环系统和扭曲的C10亚甲基构象向偏转构象。这也影响methoxybenzyl环的构象,移动它远离反式位置和放置5 '甲氧基集团在疏水口袋由Leu60更深,Pro61和Asn64 hDHFR活跃的站点。