中子衍射的研究大肠杆菌二氢叶酸还原酶和甲氨蝶呤。
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班尼特B,兰甘过世P,科茨L, Mustyakimov M,舍伯恩B,豪厄尔EE, Dealwis C
中子衍射的研究大肠杆菌二氢叶酸还原酶和甲氨蝶呤。
《美国国家科学院刊S a . 2006年12月5日,103 (49):18493 - 8。Epub 2006年11月27日。
- PubMed ID
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17130456 (在PubMed]
- 文摘
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氢原子中发挥核心作用在许多生化过程而被x射线晶体学难以想象。散裂中子源为蛋白质晶体学的新领域提供TOF测量提高数据采集效率和允许氢原子位于小晶体更大的生物大分子。这里我们报告一个2.2 a分辨率中子结构大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)与甲氨蝶呤(MTX)在复杂。中子数据收集在一个0.3毫米(3)D (2) O-soaked水晶在洛斯阿拉莫斯中子散射中心。这项研究提供了一个示例使用散裂中子研究蛋白质动力学,确定质子化作用直接从核密度图,并分析溶剂结构。我们的结构表明,堵塞循环构象(单体(星期一)]DHFR。MTX复杂经历更大的H / D交换与闭环构象异构体(mon。B),部分原因是碰到20个和β(做减法)循环容易交易所mon。a . eight-strandedβ两DHFR单分子抗H / D交换比螺旋和循环。然而,c端链,大卫王mon。几乎是完全交换。几维(2)操作系统和交换酰胺形成氢键。活性部位,MTX的N1原子质子化了的,因此当绑定DHFR指控。 Several D(2)Os are observed at hydrophobic surfaces, including two pockets near the MTX-binding site. A previously unidentified D(2)O hydrogen bonds with the catalytic D27 in mon. B, stabilizing its negative charge.