抑制人肝细胞色素p - 4502d6药效团的开发:分子建模和抑制研究。

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引用

斯特罗博,冯·克鲁德纳,斯托克伊格特,葛恩格里希,沃尔夫

抑制人肝细胞色素p - 4502d6药效团的开发:分子建模和抑制研究。

中华医学化学杂志1993年4月30日;36(9):1136-45。

PubMed ID
8487254 (查看PubMed
摘要

为了深入了解细胞色素P-450 2D6对抑制剂的特异性,使用强竞争抑制剂建立了一个初步的药效团模型。由于Ajmalicine(1)结构刚性,因此选择其为已知最强抑制剂(Ki = 3 nM)作为模板。通过对ajmalicine(1)和quinidine(9)的衍生物进行抑制研究,验证了初步的药效团模型。选择Bufuralol(18)作为底物,用高效液相色谱分离代谢产物1′-羟基Bufuralol(19)。在证明用微粒体获得的Ki值与用含有纯化细胞色素P-450 2D6的重组单加氧酶系统获得的Ki值一致后,所有的孵育都使用人肝微粒体进行。观察到Ki值在0.005到100微米之间的巨大差异。被测化合物的低能构象符合初步药效团模型。通过对这些化合物的空间和电子性质的分析,确定了最终的药效团模型。特征性质是氮原子上带正电荷和平坦的疏水区,疏水区平面几乎垂直于N-H轴,最大延伸到距氮原子7.5 a的距离。抑制性强的化合物在距离氮原子4.8 ~ 5.5 A和6.6 ~ 7.5 A的相反方向,有额外的具有负分子静电势和氢键受体性质的官能团。强和弱抑制剂的叠加导致了排除体积图的定义。 Compounds that required additional space were not inhibitors. This is apparently the first pharmacophore model for inhibitors of a cytochrome P-450 enzyme and offers the opportunity to classify compounds according to their potency of inhibition. Adverse drug interactions which occur when both substrates and inhibitors of cytochrome P-450 2D6 are applied may be predicted.

引用本文的药库数据

绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
氯丙嗪 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 7000 N/A N/A 细节
奎宁 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 15000 N/A N/A 细节
奎宁 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 4600 N/A N/A 细节
奎宁 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 5500 N/A N/A 细节
奎宁 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 21000 N/A N/A 细节
育亨宾 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 520 N/A N/A 细节
育亨宾 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 180 N/A N/A 细节
育亨宾 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 190 N/A N/A 细节
育亨宾 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 140 N/A N/A 细节
育亨宾 细胞色素P450 2D6 Ki (nM) 230 N/A N/A 细节