生物和鲁兹锥体结构表征C和寄生虫的影响设计选择性磷酸二酯酶抑制剂。

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陈昆茨王H, S, G, T塞贝克,Wan Y,罗宾逊H, Martinelli年代,H

生物和鲁兹锥体结构表征C和寄生虫的影响设计选择性磷酸二酯酶抑制剂。

生物化学杂志。2012年4月6日,287 (15):11788 - 97。doi: 10.1074 / jbc.M111.326777。Epub 2012年2月21日。

PubMed ID
22356915 (在PubMed
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文摘

鲁兹锥体磷酸二酯酶C (TcrPDEC)是一个潜在的新药的目标恰加斯病的治疗,但并没有得到充分的研究。本研究报道了各种酶学性质的kinetoplastid PDECs的晶体结构unliganded TcrPDEC1催化域及其复杂的抑制剂。突变的PDEC进化过程中导致失活的PDEC锥虫属brucei /锥虫属evansi /锥虫属congolense,而在所有其他kinetoplastids酶活跃。TcrPDEC1催化域水解营地和cGMP的K (m) 23.8妈妈和K (cat) 31(1)营地和99.1 K (m)的妈妈和一个17 K (cat) s (1) cGMP,从而确认其双特异性。晶体结构表明,氨基端片段环绕着TcrPDEC催化域,从而调节其酶活性通过与活性位点残基之间的直接交互。选择性PDE5抑制剂,230海里的IC (50) TcrPDEC1 TcrPDEC1结合在一个方向相反的西地那非。这个观察,屏幕一起对TcrPDEC人类PDE抑制剂的抑制效力,意味着一些人类的脚手架PDE抑制剂可能作为寄生虫PDE的起始模型设计抑制剂。结构研究还发现了一个独特的寄生虫的口袋里,邻居的活性部位和可能是有价值的parasite-specific抑制剂的设计。

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绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
(R) -Rolipram cAMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶4 d 集成电路50 (nM) 2.00 e + 03 7.5 24 细节
双嘧达莫 cGMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶 集成电路50 (nM) 5.00 e + 02 7.5 24 细节
药物 cGMP-inhibited 3 ', 5 '环磷酸二酯酶 集成电路50 (nM) 3.00 e + 02 7.5 24 细节
Zardaverine cAMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶4 d 集成电路50 (nM) 5.00 e + 02 7.5 24 细节