描述绑定到工程环前列腺素合成酶的底物模拟解决方案利用高分辨率核磁共振光谱和诱变:意味着环前列腺素的生物合成的分子机制。

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阮KH,吴J,塞万提斯V

描述绑定到工程环前列腺素合成酶的底物模拟解决方案利用高分辨率核磁共振光谱和诱变:意味着环前列腺素的生物合成的分子机制。

生物化学。2008年1月15日,47 (2):680 - 8。Epub 2007年12月15日。

PubMed ID

18081314 (在PubMed

]

文摘

高分辨率核磁共振光谱被用来确定一个衬底(前列腺素H2)的对接模拟(U46619)工程环前列腺素合成酶(PGI2) (PGIS)解决方案。绑定U46619 PGIS的蛋白质在1 d NMR滴定得到的显著的扰动在C-11质子的化学变化,H2C,净水U46619观察在U46619绑定到工程PGIS浓度的方式。详细的构象变化和3 d结构PGIS-bound U46619 2 d 1 h NMR实验进一步证明了使用一个技术转让。质子之间的距离h2o和H2, H18和H2, H18和H4短后绑定的PGIS solution-down在5。这些较短的距离导致广泛开放构型,在三角形的形状的U46619改为更紧凑的构象椭圆形。的结合构象U46619适合PGIS基质的晶体结构绑定口袋里大大优于游离U46619。残留的重要底物结合的活性部位的口袋PGIS也预测。例如,Trp282可能是最重要的一个残留,怀疑扮演一个角色在特定的催化功能的确定,已建立的对接研究使用的核磁共振结构PGIS-bound U46619形式和PGIS的晶体结构。这些研究提供了结构信息交互的PGIS衬底模仿。指出构象变化的其他位置接近的C-9位置U46619提供的第一个实验数据理解PGIS的催化功能的分子机制的异构化PGH2环前列腺素。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Epoprostenol	环前列腺素合成酶	蛋白质	人类	是的	诱导物	细节