响应复制应激的sumo化动态系统分析揭示了与基因组稳定性相关的新型小泛素样修饰靶蛋白和受体赖氨酸。

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肖泽，张建刚，Hendriks IA, Sigurethsson JO, Olsen JV, Vertegaal AC

响应复制应激的sumo化动态系统分析揭示了与基因组稳定性相关的新型小泛素样修饰靶蛋白和受体赖氨酸。

《Mol Cell Proteomics》2015年5月;14(5):1419-34。doi: 10.1074 / mcp.O114.044792。Epub 2015年3月9日。

PubMed ID

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摘要

由于DNA损伤，基因毒性药物可导致分裂细胞中的复制叉停止，最终导致复制叉在损伤未修复时崩溃。小泛素样修饰物(Small ubiqutin -like Modifiers, SUMO)被认为可以抵消复制压力，然而，只有少数相关的SUMO靶蛋白被知道。为了解决这个问题，我们纯化并鉴定了人类细胞中受复制应激调节的SUMO-2靶蛋白。所开发的方法能够在变性条件下单步纯化His10-SUMO-2缀合物，具有高收率和高纯度。在对5个生物重复进行统计分析后，共确定了566个SUMO-2靶标。羟基脲处理2 h后，sumo酰化有10个蛋白表达上调，2个蛋白表达下调，24 h后，有35个蛋白表达上调，13个蛋白表达下调。采用位点特异性方法在靶蛋白中定位超过1000个SUMO-2受体赖氨酸。该方法具有通用性，在泛素领域具有广泛的应用价值。这些确定的蛋白质的一个网络的功能，包括相互作用的复制因子，转录调节因子，DNA损伤反应因子，包括MDC1, atr相互作用蛋白ATRIP，布鲁姆综合征蛋白和blm结合伙伴RMI1，交叉连接内切酶EME1, BRCA1和CHAF1A。此外，在复制应激下，着丝粒蛋白和信号转导被sumo化动态调节。 Our results uncover a comprehensive network of SUMO target proteins dealing with replication damage and provide a framework for detailed understanding of the role of SUMOylation to counteract replication stress. Ultimately, our study reveals how a post-translational modification is able to orchestrate a large variety of different proteins to integrate different nuclear processes with the aim of dealing with the induced DNA damage.

引用本文的药物库数据

多肽

名字	UniProt ID
君二聚蛋白2	Q8WYK2	细节
PML蛋白	P29590	细节
异质核核糖核蛋白A2/B1	P22626	细节
异质核核糖核蛋白L	P14866	细节
剪接因子，富含脯氨酸和谷氨酰胺	P23246	细节
异质核核糖核蛋白K	P61978	细节
染色质E亚家族成员SWI/ snf相关基质相关肌动蛋白依赖调节因子1	Q969G3	细节
增殖细胞核抗原	P12004	细节
色盒蛋白同源物5	P45973	细节
Filamin-A	P21333	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
丝氨酸/精氨酸富剪接因子1	Q07955	细节
可能依赖于atp的RNA解旋酶DDX5	P17844	细节
剪接因子3B亚基1	O75533	细节
丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶PRP4同源物	Q13523	细节
增殖标志蛋白Ki-67	P46013	细节