热力学分析allosamidin绑定到一个家庭18几丁质酶。

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Cederkvist FH, Saua科幻,Karlsen V, Sakuda年代,Eijsink VG, Sorlie M

热力学分析allosamidin绑定到一个家庭18几丁质酶。

生物化学。2007年10月30日,46 (43):12347 - 54。Epub 2007 10月4。

PubMed ID

17915946 (在PubMed

]

文摘

18几丁质酶抑制的家庭正成为一个目标害虫和真菌控制以及哮喘炎症的治疗。这些酶的最佳已知的抑制剂之一是allosamidin,自然产品。而这种化合物的相互作用与家人18几丁质酶更详细地研究了x射线晶体学和酶学标准,背后的驱动力紧密绑定的细节仍然未知。我们有allosamidin绑定的热力学研究几丁质酶B (ChiB),一个家庭18从粘质沙雷氏菌几丁质酶,利用等温滴定量热法。在pH值6.0,0.16 + / - 0.04 microM Kd,绑定的反应是由熵驱动的(DeltaSr = 44大卡/ K摩尔)与一个向左反应点球(DeltaHr = 3.8 + / - 0.2千卡每摩尔)。解剖的熵的术语表明良好的构象变化allosamidin-ChiB复杂(DeltaSconf = 37大卡/ K摩尔)的反应是主要的贡献者。在pH值为8.5 Kd减少少0.03妈妈和绑定的反应是由熵有利(DeltaSr = 30大卡/ K摩尔)。而溶解熵变化(DeltaSsolv)增加15卡路里/ K摩尔在pH值6.0至46卡路里/ K摩尔在pH值为8.5,DeltaSconf变小了,小和负(8卡路里/ K摩尔)因为焓熵补偿。质子转移的分析表明,在pH值6.0绑定allosamidin Asp142-Glu144催化二分体的需要去质子化。pH值8.5,142 - 144年的二分体电离在原生酶,缓解绑定和解释为什么绑定的去质子化处罚变得enthalpically有利(DeltaHr = -1.2 + / - 0.2千卡每摩尔)。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Allosamidin	几丁质酶B	蛋白质	粘质沙雷氏菌	未知的	不可用	细节