一般两个流程模型描述了在展开条件下氢交换行为的核糖核酸酶。
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Loh SN, Rohl CA, Kiefhaber T,鲍德温RL
一般两个流程模型描述了在展开条件下氢交换行为的核糖核酸酶。
《美国国家科学院刊S a . 1996年3月5日,93 (5):1982 - 7。
- PubMed ID
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8700871 (在PubMed]
- 文摘
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核磁共振氢交换之前使用时监控核糖核酸酶的动力学演变,一些肽NH质子被发现显示EX2交换(被碱催化)除了预期EX1交换,其速度是有限的动态演变过程。在先前的研究中,两组独立显示,限制两个流程模型成功地适合发表氢本地核糖核酸酶的汇率范围0 - 0.7氯胍盐。我们发现这个模型预测属性不同于观察到的属性EX2交换核糖核酸酶的反应条件中guanidine-induced展开。模型预测,EX2交换应太快测量技术,而容易衡量。可能的解释的矛盾被认为是在这里,我们表明,消除限制从早期的两个流程模型能充分解决的矛盾;而不是指定EX2交换引起的全球正在发生的机制,我们允许它发生的一般机制,包括EX1和EX2情况。逻辑删除这个限制,因为全球的核糖核酸酶是引起EX1交换这些展开的条件。解决矛盾可以决定是否展开中间体为填充EX2交换,和这个问题被认为是其他地方。和模拟结果表明,中度或变性剂浓度高容易产生EX1交易所原生蛋白质。早期的研究表明,氢交换本地EX2蛋白质通常发生的机制,但高温或pH值高于7可能引起EX1交换。 High denaturant concentrations should be added to the list of variables likely to cause EX1 exchange.