九氨基酸转活化域的建立与预测应用。
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皮斯卡切克S，格雷戈尔M，内梅托瓦M，格拉布纳M，科瓦里克P，皮斯卡切克M
九氨基酸转活化域的建立与预测应用。
基因组学。2007年6月;89(6):756-68。Epub 2007年4月30日
- PubMed ID
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17467953 (PubMed视图］
- 摘要
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在这里，我们描述了一个新的九氨基酸转激活域9aa TAD的建立和预测应用，它是大量酵母和动物转录因子的转激活域所共有的。我们发现，9aa TAD基序是Gal4转活化结构域和相关转录因子Oaf1和Pip2的功能所必需的。9aa TAD在酵母和哺乳动物细胞中具有自主的转激活活性。利用序列比对和实验数据，导出了可用于9aa TAD预测的模式。该模式允许在其他Gal4家族成员或不相关的酵母、动物和病毒转录因子中鉴定9aa TAD。因此，9aa TAD是广泛转录因子的已知最小分母。9aa TAD的广泛出现表明该结构域介导了与一般转录辅因子的保守相互作用。9aa TAD的计算搜索可从奥地必威国际app利国家EMBnet-Node (http://www.at.embnet.org/toolbox/9aatad/)在线获得。