水辅助天冬酰胺识别由asparaginyl-tRNA合成酶的结构基础。

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Iwasaki W,关根身上,Kuroishi C, Kuramitsu年代,是M, Yokoyama年代

水辅助天冬酰胺识别由asparaginyl-tRNA合成酶的结构基础。

J杂志。2006年7月7日,360 (2):329 - 42。Epub 2006年5月15日。

PubMed ID

16753178 (在PubMed

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Asparaginyl-tRNA合成酶(AsnRS)属于二类氨酰合成酶,并负责催化tRNA的具体氨酰化(Asn)和天冬酰胺。这里,AsnRS的晶体结构从海床horikoshii,包裹着asparaginyl-adenylate (Asn-AMP),确定分辨率1.45,与自由AsnRS和AsnRS Asn-AMP模拟的复合体(Asn-SA)在1.98和1.80解决了一个决议,分别。所有的晶体结构有许多溶剂分子,形成的氢键相互作用网络包围着整个AsnRS分子。AsnRS / Asn-AMP复杂(或AsnRS / Asn-SA)绑定Asn-AMP的一侧(或Asn-SA)是完全被溶剂分子,结合位点的补充。特别是,其中两个水分子被发现直接交互和天冬酰胺酰胺羰基组,分别为形成口袋对天冬酰胺侧链的极大补充。因此,这两个水分子似乎扮演一个关键的角色在严格的天冬酰胺识别和歧视AsnRS天冬氨酸。这个水辅助天冬酰胺识别AsnRS明显与天冬氨酸的aspartyl-tRNA合成酶密切相关的是识别的实现完全通过广泛的相互作用蛋白质氨基酸残基。此外,基于对接模型AsnRS tRNA,一个精氨酸残基(Arg83) AsnRS被假定参与识别tRNA (Asn)反密码子的第三位(U36)。我们执行这个精氨酸残基的突变分析,并证实了其意义的tRNA的认可。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
天冬酰胺	天冬酰胺tRNA连接酶,胞质	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
天冬酰胺	可能天冬酰胺——tRNA连接酶、线粒体	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节