不同种族人群中11个I期药物代谢基因的遗传变异。
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Solus JF, Arietta BJ, Harris JR, Sexton DP, Steward JQ, McMunn C, Ihrie P, Mehall JM, Edwards TL, Dawson EP
不同种族人群中11个I期药物代谢基因的遗传变异。
药物基因组学。2004年10月;5(7):895-931。
- PubMed ID
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15469410 (PubMed视图］
- 摘要
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在药物代谢基因中发现的遗传变异的程度及其对药物反应的个体间变异的贡献仍然不完全了解。为了更好地确定11个I期药物代谢基因的身份和变异频率，从基因组DNA中扩增细胞色素P450 (CYP)同工酶基因CYP1A1、CYP1A2、CYP2A6、CYP2B6、CYP2C8、CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6、CYP2E1、CYP3A4和CYP3A5的外显子和侧边内含子区，并对其进行测序。从包括高加索人、非洲裔美国人和亚洲人样本的93个人类dna中，每个dna共生成了60kb的双向序列。共鉴定出388种不同的多态性。其中包括269个非编码多态性，45个同义多态性和74个非同义多态性。其中54%是新的，包括176个非编码多态性，14个同义多态性和21个非同义多态性。在观察到的新变异中，85个是由样本集中的小等位基因的单次出现所代表的。观察到的大部分变异来自低频等位基因。相比之下，这些基因变异丰富。测量遗传多样性的计算显示，虽然单个基因的值变化很大，但总体核苷酸多样性为7.7 x 10(-4)，多态性参数为11.5 x 10(-4)，高于先前报道的其他基因集。 Several independent measurements indicate that these genes are under selective pressure, particularly for polymorphisms corresponding to non-synonymous amino acid changes. There is relatively little difference in measurements of diversity among the ethnic groups, but there are large differences among the genes and gene subfamilies themselves. Of the three CYP subfamilies involved in phase I drug metabolism (1, 2, and 3), subfamily 2 displays the highest levels of genetic diversity.